Protein–RNA interactions for Protein: P38585

Ttl, Tubulin--tyrosine ligase, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtlP38585 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TtlP38585 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TtlP38585 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TtlP38585 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TtlP38585 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TtlP38585 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TtlP38585 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TtlP38585 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TtlP38585 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TtlP38585 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TtlP38585 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TtlP38585 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TtlP38585 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
TtlP38585 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TtlP38585 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TtlP38585 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TtlP38585 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TtlP38585 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TtlP38585 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TtlP38585 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
TtlP38585 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
TtlP38585 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TtlP38585 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TtlP38585 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TtlP38585 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TtlP38585 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TtlP38585 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TtlP38585 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
TtlP38585 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TtlP38585 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TtlP38585 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TtlP38585 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TtlP38585 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TtlP38585 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TtlP38585 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TtlP38585 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TtlP38585 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TtlP38585 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TtlP38585 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TtlP38585 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
TtlP38585 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TtlP38585 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TtlP38585 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TtlP38585 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TtlP38585 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TtlP38585 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TtlP38585 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
TtlP38585 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TtlP38585 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TtlP38585 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TtlP38585 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TtlP38585 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TtlP38585 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TtlP38585 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TtlP38585 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
TtlP38585 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TtlP38585 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TtlP38585 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TtlP38585 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TtlP38585 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TtlP38585 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TtlP38585 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TtlP38585 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TtlP38585 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TtlP38585 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TtlP38585 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TtlP38585 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TtlP38585 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TtlP38585 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TtlP38585 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TtlP38585 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TtlP38585 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TtlP38585 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TtlP38585 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TtlP38585 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
TtlP38585 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
TtlP38585 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TtlP38585 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TtlP38585 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TtlP38585 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TtlP38585 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TtlP38585 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TtlP38585 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
TtlP38585 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TtlP38585 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TtlP38585 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TtlP38585 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TtlP38585 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TtlP38585 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TtlP38585 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TtlP38585 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TtlP38585 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TtlP38585 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TtlP38585 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TtlP38585 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TtlP38585 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TtlP38585 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TtlP38585 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TtlP38585 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TtlP38585 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms