Protein–RNA interactions for Protein: P35295

Rab20, Ras-related protein Rab-20, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab20P35295 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rab20P35295 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rab20P35295 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rab20P35295 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rab20P35295 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Rab20P35295 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rab20P35295 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rab20P35295 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rab20P35295 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rab20P35295 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rab20P35295 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rab20P35295 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rab20P35295 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rab20P35295 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rab20P35295 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rab20P35295 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rab20P35295 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rab20P35295 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rab20P35295 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rab20P35295 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rab20P35295 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rab20P35295 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rab20P35295 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rab20P35295 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rab20P35295 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rab20P35295 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rab20P35295 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rab20P35295 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rab20P35295 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rab20P35295 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rab20P35295 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rab20P35295 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rab20P35295 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rab20P35295 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Rab20P35295 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rab20P35295 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rab20P35295 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rab20P35295 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rab20P35295 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rab20P35295 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rab20P35295 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Rab20P35295 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rab20P35295 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rab20P35295 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rab20P35295 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rab20P35295 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rab20P35295 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Rab20P35295 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Rab20P35295 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rab20P35295 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rab20P35295 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rab20P35295 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rab20P35295 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rab20P35295 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rab20P35295 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Rab20P35295 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rab20P35295 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rab20P35295 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rab20P35295 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rab20P35295 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rab20P35295 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rab20P35295 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rab20P35295 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rab20P35295 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rab20P35295 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rab20P35295 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rab20P35295 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rab20P35295 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rab20P35295 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rab20P35295 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rab20P35295 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rab20P35295 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rab20P35295 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rab20P35295 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Rab20P35295 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rab20P35295 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rab20P35295 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rab20P35295 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rab20P35295 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Rab20P35295 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Rab20P35295 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rab20P35295 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rab20P35295 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Rab20P35295 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rab20P35295 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rab20P35295 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rab20P35295 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rab20P35295 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rab20P35295 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rab20P35295 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rab20P35295 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rab20P35295 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rab20P35295 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rab20P35295 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rab20P35295 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rab20P35295 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rab20P35295 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rab20P35295 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rab20P35295 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rab20P35295 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms