Protein–RNA interactions for Protein: P35279

Rab6a, Ras-related protein Rab-6A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab6aP35279 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab6aP35279 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab6aP35279 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab6aP35279 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab6aP35279 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab6aP35279 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rab6aP35279 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab6aP35279 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab6aP35279 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab6aP35279 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab6aP35279 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab6aP35279 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab6aP35279 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab6aP35279 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab6aP35279 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab6aP35279 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rab6aP35279 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rab6aP35279 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Rab6aP35279 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab6aP35279 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rab6aP35279 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab6aP35279 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rab6aP35279 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rab6aP35279 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rab6aP35279 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab6aP35279 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab6aP35279 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab6aP35279 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab6aP35279 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab6aP35279 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab6aP35279 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab6aP35279 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab6aP35279 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab6aP35279 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab6aP35279 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab6aP35279 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab6aP35279 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab6aP35279 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab6aP35279 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab6aP35279 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab6aP35279 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab6aP35279 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab6aP35279 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab6aP35279 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab6aP35279 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab6aP35279 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab6aP35279 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab6aP35279 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab6aP35279 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab6aP35279 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab6aP35279 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab6aP35279 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab6aP35279 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab6aP35279 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab6aP35279 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab6aP35279 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab6aP35279 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab6aP35279 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab6aP35279 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab6aP35279 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab6aP35279 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab6aP35279 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab6aP35279 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab6aP35279 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab6aP35279 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab6aP35279 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab6aP35279 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab6aP35279 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab6aP35279 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab6aP35279 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab6aP35279 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab6aP35279 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab6aP35279 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab6aP35279 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab6aP35279 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab6aP35279 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab6aP35279 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab6aP35279 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab6aP35279 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab6aP35279 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab6aP35279 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab6aP35279 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab6aP35279 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab6aP35279 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab6aP35279 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab6aP35279 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab6aP35279 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab6aP35279 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab6aP35279 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab6aP35279 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab6aP35279 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab6aP35279 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab6aP35279 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab6aP35279 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab6aP35279 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab6aP35279 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab6aP35279 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab6aP35279 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab6aP35279 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab6aP35279 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms