Protein–RNA interactions for Protein: P33609

Pola1, DNA polymerase alpha catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 1,465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pola1P33609 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pola1P33609 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pola1P33609 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pola1P33609 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pola1P33609 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pola1P33609 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pola1P33609 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pola1P33609 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pola1P33609 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pola1P33609 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pola1P33609 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pola1P33609 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pola1P33609 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pola1P33609 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pola1P33609 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pola1P33609 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Pola1P33609 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pola1P33609 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pola1P33609 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pola1P33609 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pola1P33609 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pola1P33609 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pola1P33609 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pola1P33609 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pola1P33609 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pola1P33609 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Pola1P33609 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pola1P33609 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pola1P33609 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pola1P33609 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pola1P33609 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pola1P33609 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pola1P33609 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pola1P33609 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pola1P33609 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Pola1P33609 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pola1P33609 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pola1P33609 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pola1P33609 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pola1P33609 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pola1P33609 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pola1P33609 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Pola1P33609 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pola1P33609 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Pola1P33609 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pola1P33609 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pola1P33609 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pola1P33609 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pola1P33609 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pola1P33609 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pola1P33609 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pola1P33609 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pola1P33609 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pola1P33609 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pola1P33609 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Pola1P33609 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Pola1P33609 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pola1P33609 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pola1P33609 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pola1P33609 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Pola1P33609 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pola1P33609 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pola1P33609 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pola1P33609 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pola1P33609 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Pola1P33609 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pola1P33609 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pola1P33609 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pola1P33609 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pola1P33609 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pola1P33609 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pola1P33609 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pola1P33609 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pola1P33609 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pola1P33609 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pola1P33609 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pola1P33609 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Pola1P33609 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pola1P33609 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pola1P33609 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pola1P33609 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pola1P33609 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pola1P33609 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pola1P33609 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pola1P33609 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pola1P33609 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pola1P33609 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pola1P33609 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pola1P33609 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pola1P33609 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pola1P33609 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pola1P33609 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pola1P33609 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pola1P33609 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Pola1P33609 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pola1P33609 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pola1P33609 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pola1P33609 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pola1P33609 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pola1P33609 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms