Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd28P31041 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd28P31041 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd28P31041 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd28P31041 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd28P31041 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd28P31041 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd28P31041 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd28P31041 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd28P31041 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd28P31041 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd28P31041 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd28P31041 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd28P31041 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd28P31041 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd28P31041 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd28P31041 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd28P31041 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd28P31041 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd28P31041 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd28P31041 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd28P31041 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd28P31041 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd28P31041 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd28P31041 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd28P31041 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd28P31041 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd28P31041 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd28P31041 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd28P31041 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd28P31041 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd28P31041 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd28P31041 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd28P31041 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cd28P31041 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cd28P31041 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cd28P31041 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cd28P31041 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cd28P31041 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cd28P31041 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cd28P31041 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cd28P31041 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cd28P31041 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cd28P31041 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cd28P31041 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cd28P31041 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cd28P31041 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cd28P31041 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cd28P31041 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cd28P31041 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd28P31041 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd28P31041 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd28P31041 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd28P31041 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd28P31041 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd28P31041 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd28P31041 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd28P31041 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd28P31041 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd28P31041 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd28P31041 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd28P31041 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd28P31041 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd28P31041 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd28P31041 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd28P31041 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd28P31041 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd28P31041 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd28P31041 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd28P31041 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd28P31041 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd28P31041 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd28P31041 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd28P31041 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd28P31041 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd28P31041 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd28P31041 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd28P31041 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd28P31041 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cd28P31041 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cd28P31041 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cd28P31041 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cd28P31041 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cd28P31041 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cd28P31041 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cd28P31041 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cd28P31041 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Cd28P31041 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cd28P31041 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cd28P31041 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cd28P31041 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cd28P31041 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cd28P31041 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cd28P31041 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cd28P31041 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cd28P31041 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cd28P31041 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cd28P31041 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cd28P31041 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cd28P31041 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms