Protein–RNA interactions for Protein: P30204

Msr1, Macrophage scavenger receptor types I and II, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msr1P30204 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Msr1P30204 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Msr1P30204 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Msr1P30204 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Msr1P30204 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Msr1P30204 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Msr1P30204 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Msr1P30204 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Msr1P30204 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Msr1P30204 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Msr1P30204 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Msr1P30204 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Msr1P30204 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Msr1P30204 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Msr1P30204 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Msr1P30204 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Msr1P30204 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Msr1P30204 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Msr1P30204 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Msr1P30204 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Msr1P30204 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Msr1P30204 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Msr1P30204 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Msr1P30204 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Msr1P30204 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Msr1P30204 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Msr1P30204 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Msr1P30204 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Msr1P30204 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Msr1P30204 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Msr1P30204 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Msr1P30204 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Msr1P30204 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Msr1P30204 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Msr1P30204 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Msr1P30204 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Msr1P30204 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Msr1P30204 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Msr1P30204 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Msr1P30204 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Msr1P30204 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Msr1P30204 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Msr1P30204 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Msr1P30204 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Msr1P30204 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Msr1P30204 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Msr1P30204 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Msr1P30204 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Msr1P30204 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Msr1P30204 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Msr1P30204 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Msr1P30204 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Msr1P30204 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Msr1P30204 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Msr1P30204 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Msr1P30204 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Msr1P30204 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Msr1P30204 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Msr1P30204 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Msr1P30204 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Msr1P30204 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Msr1P30204 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Msr1P30204 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Msr1P30204 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Msr1P30204 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Msr1P30204 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Msr1P30204 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Msr1P30204 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Msr1P30204 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Msr1P30204 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Msr1P30204 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Msr1P30204 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Msr1P30204 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Msr1P30204 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Msr1P30204 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Msr1P30204 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Msr1P30204 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Msr1P30204 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Msr1P30204 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Msr1P30204 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Msr1P30204 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Msr1P30204 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Msr1P30204 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Msr1P30204 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Msr1P30204 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Msr1P30204 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Msr1P30204 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Msr1P30204 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Msr1P30204 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Msr1P30204 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Msr1P30204 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Msr1P30204 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Msr1P30204 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Msr1P30204 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Msr1P30204 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Msr1P30204 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Msr1P30204 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Msr1P30204 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Msr1P30204 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Msr1P30204 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms