Protein–RNA interactions for Protein: P29452

Casp1, Caspase-1, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp1P29452 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Casp1P29452 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Casp1P29452 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Casp1P29452 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Casp1P29452 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Casp1P29452 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Casp1P29452 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Casp1P29452 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Casp1P29452 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Casp1P29452 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Casp1P29452 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Casp1P29452 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Casp1P29452 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Casp1P29452 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Casp1P29452 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Casp1P29452 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Casp1P29452 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Casp1P29452 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Casp1P29452 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Casp1P29452 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Casp1P29452 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Casp1P29452 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Casp1P29452 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Casp1P29452 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Casp1P29452 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Casp1P29452 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Casp1P29452 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Casp1P29452 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Casp1P29452 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Casp1P29452 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Casp1P29452 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Casp1P29452 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Casp1P29452 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Casp1P29452 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Casp1P29452 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Casp1P29452 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Casp1P29452 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Casp1P29452 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Casp1P29452 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Casp1P29452 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Casp1P29452 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Casp1P29452 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Casp1P29452 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Casp1P29452 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Casp1P29452 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Casp1P29452 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Casp1P29452 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Casp1P29452 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Casp1P29452 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Casp1P29452 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Casp1P29452 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Casp1P29452 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Casp1P29452 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Casp1P29452 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Casp1P29452 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Casp1P29452 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Casp1P29452 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Casp1P29452 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Casp1P29452 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Casp1P29452 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Casp1P29452 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Casp1P29452 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Casp1P29452 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Casp1P29452 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Casp1P29452 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Casp1P29452 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Casp1P29452 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Casp1P29452 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Casp1P29452 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Casp1P29452 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Casp1P29452 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Casp1P29452 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Casp1P29452 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Casp1P29452 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Casp1P29452 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Casp1P29452 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Casp1P29452 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Casp1P29452 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Casp1P29452 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Casp1P29452 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Casp1P29452 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Casp1P29452 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Casp1P29452 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Casp1P29452 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Casp1P29452 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Casp1P29452 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Casp1P29452 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Casp1P29452 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Casp1P29452 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Casp1P29452 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Casp1P29452 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Casp1P29452 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Casp1P29452 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Casp1P29452 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Casp1P29452 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Casp1P29452 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Casp1P29452 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Casp1P29452 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Casp1P29452 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Casp1P29452 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms