Protein–RNA interactions for Protein: P28867

Prkcd, Protein kinase C delta type, mousemouse

Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcdP28867 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PrkcdP28867 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PrkcdP28867 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PrkcdP28867 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PrkcdP28867 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PrkcdP28867 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PrkcdP28867 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PrkcdP28867 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PrkcdP28867 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PrkcdP28867 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PrkcdP28867 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PrkcdP28867 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PrkcdP28867 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PrkcdP28867 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PrkcdP28867 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PrkcdP28867 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PrkcdP28867 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PrkcdP28867 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PrkcdP28867 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PrkcdP28867 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PrkcdP28867 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PrkcdP28867 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PrkcdP28867 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PrkcdP28867 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PrkcdP28867 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PrkcdP28867 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PrkcdP28867 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PrkcdP28867 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PrkcdP28867 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PrkcdP28867 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PrkcdP28867 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PrkcdP28867 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PrkcdP28867 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PrkcdP28867 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PrkcdP28867 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PrkcdP28867 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PrkcdP28867 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PrkcdP28867 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PrkcdP28867 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PrkcdP28867 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PrkcdP28867 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PrkcdP28867 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PrkcdP28867 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PrkcdP28867 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PrkcdP28867 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PrkcdP28867 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PrkcdP28867 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PrkcdP28867 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PrkcdP28867 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PrkcdP28867 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PrkcdP28867 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PrkcdP28867 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PrkcdP28867 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PrkcdP28867 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PrkcdP28867 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PrkcdP28867 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PrkcdP28867 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PrkcdP28867 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PrkcdP28867 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PrkcdP28867 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PrkcdP28867 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
PrkcdP28867 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PrkcdP28867 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PrkcdP28867 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PrkcdP28867 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PrkcdP28867 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PrkcdP28867 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PrkcdP28867 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PrkcdP28867 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PrkcdP28867 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PrkcdP28867 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PrkcdP28867 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PrkcdP28867 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
PrkcdP28867 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PrkcdP28867 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PrkcdP28867 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PrkcdP28867 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PrkcdP28867 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PrkcdP28867 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PrkcdP28867 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PrkcdP28867 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PrkcdP28867 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PrkcdP28867 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PrkcdP28867 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PrkcdP28867 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PrkcdP28867 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PrkcdP28867 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PrkcdP28867 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PrkcdP28867 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PrkcdP28867 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PrkcdP28867 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PrkcdP28867 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PrkcdP28867 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PrkcdP28867 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PrkcdP28867 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PrkcdP28867 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PrkcdP28867 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PrkcdP28867 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PrkcdP28867 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PrkcdP28867 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms