Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hoxd10P28359 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hoxd10P28359 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hoxd10P28359 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hoxd10P28359 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Hoxd10P28359 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hoxd10P28359 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hoxd10P28359 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Hoxd10P28359 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hoxd10P28359 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hoxd10P28359 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hoxd10P28359 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Hoxd10P28359 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hoxd10P28359 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hoxd10P28359 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hoxd10P28359 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Hoxd10P28359 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Hoxd10P28359 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hoxd10P28359 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hoxd10P28359 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hoxd10P28359 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hoxd10P28359 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hoxd10P28359 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hoxd10P28359 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hoxd10P28359 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hoxd10P28359 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Hoxd10P28359 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hoxd10P28359 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hoxd10P28359 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hoxd10P28359 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hoxd10P28359 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hoxd10P28359 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hoxd10P28359 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hoxd10P28359 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hoxd10P28359 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hoxd10P28359 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hoxd10P28359 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hoxd10P28359 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hoxd10P28359 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Hoxd10P28359 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hoxd10P28359 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hoxd10P28359 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hoxd10P28359 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hoxd10P28359 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hoxd10P28359 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hoxd10P28359 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Hoxd10P28359 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hoxd10P28359 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Hoxd10P28359 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hoxd10P28359 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hoxd10P28359 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hoxd10P28359 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Hoxd10P28359 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hoxd10P28359 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hoxd10P28359 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hoxd10P28359 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hoxd10P28359 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hoxd10P28359 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hoxd10P28359 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hoxd10P28359 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hoxd10P28359 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hoxd10P28359 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hoxd10P28359 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
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Hoxd10P28359 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hoxd10P28359 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hoxd10P28359 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
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Hoxd10P28359 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
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Hoxd10P28359 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hoxd10P28359 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hoxd10P28359 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hoxd10P28359 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hoxd10P28359 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hoxd10P28359 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Hoxd10P28359 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hoxd10P28359 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hoxd10P28359 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hoxd10P28359 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hoxd10P28359 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hoxd10P28359 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hoxd10P28359 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Hoxd10P28359 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Hoxd10P28359 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hoxd10P28359 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hoxd10P28359 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hoxd10P28359 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hoxd10P28359 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hoxd10P28359 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hoxd10P28359 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hoxd10P28359 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hoxd10P28359 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hoxd10P28359 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hoxd10P28359 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hoxd10P28359 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hoxd10P28359 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hoxd10P28359 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hoxd10P28359 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hoxd10P28359 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
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