Protein–RNA interactions for Protein: P28322

Etv4, ETS translocation variant 4, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Etv4P28322 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Etv4P28322 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Etv4P28322 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Etv4P28322 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Etv4P28322 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Etv4P28322 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Etv4P28322 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Etv4P28322 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Etv4P28322 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Etv4P28322 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Etv4P28322 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Etv4P28322 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Etv4P28322 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Etv4P28322 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Etv4P28322 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Etv4P28322 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Etv4P28322 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Etv4P28322 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Etv4P28322 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Etv4P28322 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Etv4P28322 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Etv4P28322 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Etv4P28322 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Etv4P28322 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Etv4P28322 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Etv4P28322 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Etv4P28322 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Etv4P28322 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Etv4P28322 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Etv4P28322 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Etv4P28322 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Etv4P28322 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Etv4P28322 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Etv4P28322 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Etv4P28322 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Etv4P28322 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Etv4P28322 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Etv4P28322 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Etv4P28322 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Etv4P28322 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Etv4P28322 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Etv4P28322 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Etv4P28322 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Etv4P28322 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Etv4P28322 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Etv4P28322 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Etv4P28322 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Etv4P28322 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Etv4P28322 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Etv4P28322 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Etv4P28322 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Etv4P28322 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Etv4P28322 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Etv4P28322 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Etv4P28322 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Etv4P28322 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Etv4P28322 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Etv4P28322 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Etv4P28322 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Etv4P28322 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Etv4P28322 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Etv4P28322 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Etv4P28322 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Etv4P28322 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Etv4P28322 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Etv4P28322 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Etv4P28322 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Etv4P28322 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Etv4P28322 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Etv4P28322 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Etv4P28322 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Etv4P28322 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Etv4P28322 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Etv4P28322 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Etv4P28322 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Etv4P28322 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Etv4P28322 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Etv4P28322 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Etv4P28322 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Etv4P28322 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Etv4P28322 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Etv4P28322 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Etv4P28322 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Etv4P28322 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Etv4P28322 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Etv4P28322 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Etv4P28322 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Etv4P28322 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Etv4P28322 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Etv4P28322 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Etv4P28322 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Etv4P28322 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Etv4P28322 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Etv4P28322 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Etv4P28322 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Etv4P28322 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Etv4P28322 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Etv4P28322 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Etv4P28322 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Etv4P28322 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms