Protein–RNA interactions for Protein: P28309

Defa2, Alpha-defensin 2, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa2P28309 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Defa2P28309 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Defa2P28309 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Defa2P28309 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Defa2P28309 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Defa2P28309 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Defa2P28309 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Defa2P28309 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Defa2P28309 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Defa2P28309 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Defa2P28309 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Defa2P28309 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Defa2P28309 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Defa2P28309 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Defa2P28309 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Defa2P28309 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Defa2P28309 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Defa2P28309 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Defa2P28309 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Defa2P28309 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Defa2P28309 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Defa2P28309 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Defa2P28309 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Defa2P28309 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Defa2P28309 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Defa2P28309 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Defa2P28309 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Defa2P28309 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Defa2P28309 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Defa2P28309 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Defa2P28309 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Defa2P28309 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Defa2P28309 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Defa2P28309 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Defa2P28309 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Defa2P28309 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Defa2P28309 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Defa2P28309 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Defa2P28309 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Defa2P28309 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Defa2P28309 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Defa2P28309 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Defa2P28309 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Defa2P28309 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Defa2P28309 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Defa2P28309 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Defa2P28309 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Defa2P28309 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Defa2P28309 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Defa2P28309 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Defa2P28309 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Defa2P28309 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Defa2P28309 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Defa2P28309 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Defa2P28309 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Defa2P28309 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Defa2P28309 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Defa2P28309 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Defa2P28309 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Defa2P28309 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Defa2P28309 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Defa2P28309 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Defa2P28309 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Defa2P28309 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Defa2P28309 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Defa2P28309 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Defa2P28309 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Defa2P28309 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Defa2P28309 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Defa2P28309 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Defa2P28309 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Defa2P28309 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Defa2P28309 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Defa2P28309 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Defa2P28309 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Defa2P28309 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Defa2P28309 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Defa2P28309 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Defa2P28309 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Defa2P28309 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Defa2P28309 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Defa2P28309 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Defa2P28309 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Defa2P28309 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Defa2P28309 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Defa2P28309 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Defa2P28309 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Defa2P28309 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Defa2P28309 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Defa2P28309 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Defa2P28309 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Defa2P28309 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Defa2P28309 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Defa2P28309 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Defa2P28309 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Defa2P28309 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Defa2P28309 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Defa2P28309 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Defa2P28309 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Defa2P28309 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms