Protein–RNA interactions for Protein: P28231

Gjb3, Gap junction beta-3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb3P28231 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gjb3P28231 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gjb3P28231 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gjb3P28231 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gjb3P28231 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gjb3P28231 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gjb3P28231 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gjb3P28231 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gjb3P28231 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gjb3P28231 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gjb3P28231 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gjb3P28231 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gjb3P28231 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gjb3P28231 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gjb3P28231 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gjb3P28231 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gjb3P28231 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gjb3P28231 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gjb3P28231 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gjb3P28231 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gjb3P28231 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gjb3P28231 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gjb3P28231 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gjb3P28231 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gjb3P28231 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gjb3P28231 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Gjb3P28231 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gjb3P28231 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gjb3P28231 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gjb3P28231 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gjb3P28231 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gjb3P28231 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gjb3P28231 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gjb3P28231 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gjb3P28231 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gjb3P28231 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gjb3P28231 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gjb3P28231 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Gjb3P28231 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gjb3P28231 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gjb3P28231 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gjb3P28231 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gjb3P28231 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gjb3P28231 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gjb3P28231 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Gjb3P28231 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gjb3P28231 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Gjb3P28231 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gjb3P28231 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Gjb3P28231 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gjb3P28231 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gjb3P28231 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gjb3P28231 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gjb3P28231 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gjb3P28231 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gjb3P28231 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gjb3P28231 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gjb3P28231 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gjb3P28231 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gjb3P28231 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gjb3P28231 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gjb3P28231 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gjb3P28231 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gjb3P28231 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gjb3P28231 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gjb3P28231 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gjb3P28231 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gjb3P28231 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gjb3P28231 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gjb3P28231 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gjb3P28231 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gjb3P28231 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gjb3P28231 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gjb3P28231 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gjb3P28231 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gjb3P28231 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gjb3P28231 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gjb3P28231 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gjb3P28231 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gjb3P28231 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gjb3P28231 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gjb3P28231 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gjb3P28231 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gjb3P28231 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Gjb3P28231 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Gjb3P28231 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gjb3P28231 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gjb3P28231 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gjb3P28231 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Gjb3P28231 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gjb3P28231 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gjb3P28231 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gjb3P28231 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gjb3P28231 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gjb3P28231 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gjb3P28231 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gjb3P28231 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gjb3P28231 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gjb3P28231 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gjb3P28231 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms