Protein–RNA interactions for Protein: P28028

Braf, Serine/threonine-protein kinase B-raf, mousemouse

Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BrafP28028 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BrafP28028 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
BrafP28028 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
BrafP28028 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
BrafP28028 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
BrafP28028 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
BrafP28028 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
BrafP28028 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
BrafP28028 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
BrafP28028 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
BrafP28028 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BrafP28028 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BrafP28028 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BrafP28028 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BrafP28028 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BrafP28028 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BrafP28028 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BrafP28028 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BrafP28028 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BrafP28028 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BrafP28028 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BrafP28028 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BrafP28028 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BrafP28028 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BrafP28028 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BrafP28028 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BrafP28028 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BrafP28028 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BrafP28028 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BrafP28028 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BrafP28028 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
BrafP28028 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BrafP28028 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BrafP28028 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BrafP28028 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BrafP28028 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BrafP28028 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BrafP28028 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BrafP28028 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BrafP28028 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BrafP28028 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BrafP28028 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BrafP28028 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BrafP28028 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BrafP28028 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BrafP28028 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BrafP28028 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BrafP28028 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BrafP28028 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BrafP28028 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BrafP28028 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BrafP28028 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BrafP28028 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BrafP28028 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BrafP28028 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
BrafP28028 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BrafP28028 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BrafP28028 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BrafP28028 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BrafP28028 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BrafP28028 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BrafP28028 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BrafP28028 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BrafP28028 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
BrafP28028 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BrafP28028 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BrafP28028 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BrafP28028 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BrafP28028 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BrafP28028 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BrafP28028 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BrafP28028 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BrafP28028 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BrafP28028 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BrafP28028 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BrafP28028 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BrafP28028 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BrafP28028 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BrafP28028 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BrafP28028 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BrafP28028 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BrafP28028 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BrafP28028 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BrafP28028 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BrafP28028 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BrafP28028 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BrafP28028 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BrafP28028 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BrafP28028 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BrafP28028 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BrafP28028 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BrafP28028 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
BrafP28028 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BrafP28028 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BrafP28028 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BrafP28028 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BrafP28028 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BrafP28028 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BrafP28028 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BrafP28028 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms