Protein–RNA interactions for Protein: P27782

Lef1, Lymphoid enhancer-binding factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lef1P27782 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lef1P27782 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lef1P27782 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lef1P27782 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lef1P27782 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lef1P27782 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Lef1P27782 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lef1P27782 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lef1P27782 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lef1P27782 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lef1P27782 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lef1P27782 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lef1P27782 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lef1P27782 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Lef1P27782 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lef1P27782 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lef1P27782 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lef1P27782 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lef1P27782 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lef1P27782 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lef1P27782 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lef1P27782 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lef1P27782 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lef1P27782 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Lef1P27782 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lef1P27782 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lef1P27782 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lef1P27782 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lef1P27782 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lef1P27782 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lef1P27782 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lef1P27782 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Lef1P27782 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lef1P27782 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lef1P27782 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lef1P27782 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lef1P27782 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lef1P27782 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lef1P27782 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lef1P27782 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lef1P27782 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Lef1P27782 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lef1P27782 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lef1P27782 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lef1P27782 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lef1P27782 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lef1P27782 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Lef1P27782 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lef1P27782 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lef1P27782 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lef1P27782 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lef1P27782 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lef1P27782 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lef1P27782 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lef1P27782 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lef1P27782 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lef1P27782 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lef1P27782 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lef1P27782 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lef1P27782 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lef1P27782 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lef1P27782 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lef1P27782 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lef1P27782 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lef1P27782 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lef1P27782 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lef1P27782 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lef1P27782 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lef1P27782 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lef1P27782 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lef1P27782 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lef1P27782 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lef1P27782 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lef1P27782 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lef1P27782 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Lef1P27782 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lef1P27782 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lef1P27782 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lef1P27782 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lef1P27782 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lef1P27782 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lef1P27782 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lef1P27782 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lef1P27782 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lef1P27782 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lef1P27782 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lef1P27782 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lef1P27782 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lef1P27782 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lef1P27782 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lef1P27782 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lef1P27782 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lef1P27782 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lef1P27782 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lef1P27782 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lef1P27782 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lef1P27782 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Lef1P27782 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lef1P27782 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lef1P27782 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms