Protein–RNA interactions for Protein: P25425

Pou2f1, POU domain, class 2, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 770 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou2f1P25425 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pou2f1P25425 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pou2f1P25425 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pou2f1P25425 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pou2f1P25425 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pou2f1P25425 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pou2f1P25425 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pou2f1P25425 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pou2f1P25425 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pou2f1P25425 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pou2f1P25425 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pou2f1P25425 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pou2f1P25425 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pou2f1P25425 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pou2f1P25425 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pou2f1P25425 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pou2f1P25425 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pou2f1P25425 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pou2f1P25425 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pou2f1P25425 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pou2f1P25425 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Pou2f1P25425 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pou2f1P25425 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pou2f1P25425 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pou2f1P25425 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pou2f1P25425 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pou2f1P25425 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pou2f1P25425 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pou2f1P25425 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pou2f1P25425 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pou2f1P25425 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pou2f1P25425 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Pou2f1P25425 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pou2f1P25425 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pou2f1P25425 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pou2f1P25425 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pou2f1P25425 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pou2f1P25425 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pou2f1P25425 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pou2f1P25425 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pou2f1P25425 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pou2f1P25425 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pou2f1P25425 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pou2f1P25425 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pou2f1P25425 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pou2f1P25425 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pou2f1P25425 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pou2f1P25425 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pou2f1P25425 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pou2f1P25425 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pou2f1P25425 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pou2f1P25425 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pou2f1P25425 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pou2f1P25425 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Pou2f1P25425 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pou2f1P25425 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pou2f1P25425 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pou2f1P25425 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pou2f1P25425 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pou2f1P25425 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pou2f1P25425 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pou2f1P25425 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pou2f1P25425 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pou2f1P25425 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pou2f1P25425 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pou2f1P25425 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pou2f1P25425 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pou2f1P25425 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pou2f1P25425 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pou2f1P25425 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pou2f1P25425 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pou2f1P25425 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pou2f1P25425 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Pou2f1P25425 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pou2f1P25425 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pou2f1P25425 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pou2f1P25425 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pou2f1P25425 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pou2f1P25425 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pou2f1P25425 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pou2f1P25425 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pou2f1P25425 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pou2f1P25425 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pou2f1P25425 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pou2f1P25425 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pou2f1P25425 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pou2f1P25425 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pou2f1P25425 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pou2f1P25425 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pou2f1P25425 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pou2f1P25425 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pou2f1P25425 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pou2f1P25425 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pou2f1P25425 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pou2f1P25425 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pou2f1P25425 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pou2f1P25425 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pou2f1P25425 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pou2f1P25425 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pou2f1P25425 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms