Protein–RNA interactions for Protein: P24788

Cdk11b, Cyclin-dependent kinase 11B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk11bP24788 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Cdk11bP24788 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Cdk11bP24788 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Cdk11bP24788 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Cdk11bP24788 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Cdk11bP24788 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Cdk11bP24788 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Cdk11bP24788 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cdk11bP24788 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cdk11bP24788 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cdk11bP24788 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cdk11bP24788 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cdk11bP24788 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cdk11bP24788 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cdk11bP24788 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Cdk11bP24788 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Cdk11bP24788 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cdk11bP24788 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cdk11bP24788 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cdk11bP24788 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Cdk11bP24788 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cdk11bP24788 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cdk11bP24788 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cdk11bP24788 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Cdk11bP24788 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cdk11bP24788 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cdk11bP24788 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cdk11bP24788 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cdk11bP24788 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cdk11bP24788 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cdk11bP24788 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cdk11bP24788 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cdk11bP24788 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Cdk11bP24788 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Cdk11bP24788 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Cdk11bP24788 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Cdk11bP24788 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Cdk11bP24788 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Cdk11bP24788 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Cdk11bP24788 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Cdk11bP24788 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Cdk11bP24788 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Cdk11bP24788 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
Cdk11bP24788 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Cdk11bP24788 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Cdk11bP24788 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Cdk11bP24788 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Cdk11bP24788 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Cdk11bP24788 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Cdk11bP24788 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Cdk11bP24788 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Cdk11bP24788 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cdk11bP24788 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cdk11bP24788 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cdk11bP24788 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Cdk11bP24788 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cdk11bP24788 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cdk11bP24788 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cdk11bP24788 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Cdk11bP24788 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Cdk11bP24788 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Cdk11bP24788 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Cdk11bP24788 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Cdk11bP24788 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Cdk11bP24788 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Cdk11bP24788 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Cdk11bP24788 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Cdk11bP24788 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Cdk11bP24788 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Cdk11bP24788 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Cdk11bP24788 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Cdk11bP24788 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Cdk11bP24788 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Cdk11bP24788 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Cdk11bP24788 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Cdk11bP24788 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Cdk11bP24788 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Cdk11bP24788 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Cdk11bP24788 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Cdk11bP24788 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Cdk11bP24788 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Cdk11bP24788 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Cdk11bP24788 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Cdk11bP24788 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Cdk11bP24788 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Cdk11bP24788 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Cdk11bP24788 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Cdk11bP24788 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Cdk11bP24788 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Cdk11bP24788 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cdk11bP24788 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cdk11bP24788 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cdk11bP24788 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cdk11bP24788 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cdk11bP24788 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cdk11bP24788 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cdk11bP24788 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cdk11bP24788 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Cdk11bP24788 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Cdk11bP24788 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms