Protein–RNA interactions for Protein: P24161

Cd247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, mousemouse

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd247P24161 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cd247P24161 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cd247P24161 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cd247P24161 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cd247P24161 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cd247P24161 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cd247P24161 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cd247P24161 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cd247P24161 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Cd247P24161 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cd247P24161 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cd247P24161 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cd247P24161 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cd247P24161 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cd247P24161 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cd247P24161 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cd247P24161 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cd247P24161 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Cd247P24161 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cd247P24161 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cd247P24161 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cd247P24161 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cd247P24161 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cd247P24161 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cd247P24161 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cd247P24161 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cd247P24161 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cd247P24161 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cd247P24161 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Cd247P24161 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cd247P24161 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cd247P24161 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cd247P24161 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cd247P24161 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cd247P24161 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cd247P24161 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cd247P24161 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Cd247P24161 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cd247P24161 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cd247P24161 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cd247P24161 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cd247P24161 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Cd247P24161 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Cd247P24161 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Cd247P24161 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Cd247P24161 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cd247P24161 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cd247P24161 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cd247P24161 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cd247P24161 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cd247P24161 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cd247P24161 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cd247P24161 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cd247P24161 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cd247P24161 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cd247P24161 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Cd247P24161 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Cd247P24161 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cd247P24161 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Cd247P24161 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Cd247P24161 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cd247P24161 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Cd247P24161 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cd247P24161 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cd247P24161 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cd247P24161 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cd247P24161 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cd247P24161 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cd247P24161 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cd247P24161 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cd247P24161 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cd247P24161 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cd247P24161 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cd247P24161 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cd247P24161 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cd247P24161 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Cd247P24161 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cd247P24161 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Cd247P24161 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cd247P24161 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cd247P24161 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cd247P24161 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cd247P24161 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cd247P24161 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cd247P24161 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cd247P24161 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cd247P24161 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cd247P24161 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cd247P24161 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Cd247P24161 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cd247P24161 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cd247P24161 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cd247P24161 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cd247P24161 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cd247P24161 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cd247P24161 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cd247P24161 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Cd247P24161 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Cd247P24161 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cd247P24161 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms