Protein–RNA interactions for Protein: P23818

Gria1, Glutamate receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gria1P23818 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gria1P23818 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gria1P23818 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gria1P23818 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gria1P23818 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gria1P23818 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gria1P23818 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gria1P23818 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gria1P23818 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gria1P23818 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gria1P23818 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gria1P23818 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gria1P23818 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Gria1P23818 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gria1P23818 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gria1P23818 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gria1P23818 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gria1P23818 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gria1P23818 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gria1P23818 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gria1P23818 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gria1P23818 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gria1P23818 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gria1P23818 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gria1P23818 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gria1P23818 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gria1P23818 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gria1P23818 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gria1P23818 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gria1P23818 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gria1P23818 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gria1P23818 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gria1P23818 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gria1P23818 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Gria1P23818 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gria1P23818 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gria1P23818 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gria1P23818 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gria1P23818 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gria1P23818 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Gria1P23818 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gria1P23818 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gria1P23818 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gria1P23818 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gria1P23818 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gria1P23818 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gria1P23818 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gria1P23818 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gria1P23818 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gria1P23818 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gria1P23818 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gria1P23818 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gria1P23818 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gria1P23818 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gria1P23818 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gria1P23818 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gria1P23818 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Gria1P23818 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gria1P23818 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gria1P23818 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gria1P23818 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gria1P23818 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gria1P23818 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gria1P23818 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gria1P23818 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gria1P23818 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gria1P23818 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gria1P23818 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gria1P23818 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gria1P23818 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gria1P23818 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gria1P23818 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gria1P23818 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gria1P23818 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gria1P23818 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gria1P23818 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gria1P23818 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gria1P23818 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gria1P23818 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gria1P23818 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gria1P23818 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gria1P23818 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gria1P23818 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gria1P23818 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gria1P23818 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gria1P23818 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gria1P23818 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gria1P23818 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gria1P23818 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gria1P23818 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gria1P23818 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gria1P23818 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gria1P23818 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gria1P23818 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gria1P23818 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gria1P23818 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gria1P23818 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gria1P23818 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gria1P23818 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gria1P23818 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms