Protein–RNA interactions for Protein: P20664

Prim1, DNA primase small subunit, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prim1P20664 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Prim1P20664 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Prim1P20664 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Prim1P20664 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Prim1P20664 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Prim1P20664 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Prim1P20664 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Prim1P20664 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Prim1P20664 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Prim1P20664 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Prim1P20664 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Prim1P20664 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Prim1P20664 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Prim1P20664 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Prim1P20664 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Prim1P20664 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Prim1P20664 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Prim1P20664 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Prim1P20664 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Prim1P20664 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Prim1P20664 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Prim1P20664 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Prim1P20664 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Prim1P20664 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Prim1P20664 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Prim1P20664 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Prim1P20664 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Prim1P20664 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Prim1P20664 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Prim1P20664 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Prim1P20664 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Prim1P20664 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Prim1P20664 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Prim1P20664 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Prim1P20664 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Prim1P20664 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Prim1P20664 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Prim1P20664 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Prim1P20664 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Prim1P20664 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Prim1P20664 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Prim1P20664 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Prim1P20664 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Prim1P20664 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Prim1P20664 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Prim1P20664 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Prim1P20664 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Prim1P20664 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Prim1P20664 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Prim1P20664 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Prim1P20664 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Prim1P20664 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Prim1P20664 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Prim1P20664 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Prim1P20664 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Prim1P20664 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Prim1P20664 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Prim1P20664 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Prim1P20664 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Prim1P20664 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Prim1P20664 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Prim1P20664 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Prim1P20664 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Prim1P20664 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Prim1P20664 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Prim1P20664 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Prim1P20664 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Prim1P20664 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Prim1P20664 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Prim1P20664 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Prim1P20664 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Prim1P20664 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Prim1P20664 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Prim1P20664 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Prim1P20664 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Prim1P20664 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Prim1P20664 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Prim1P20664 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Prim1P20664 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Prim1P20664 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Prim1P20664 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Prim1P20664 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Prim1P20664 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Prim1P20664 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Prim1P20664 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Prim1P20664 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Prim1P20664 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Prim1P20664 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Prim1P20664 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Prim1P20664 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Prim1P20664 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Prim1P20664 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Prim1P20664 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Prim1P20664 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Prim1P20664 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Prim1P20664 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Prim1P20664 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Prim1P20664 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Prim1P20664 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Prim1P20664 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms