Protein–RNA interactions for Protein: P20181

Ntf3, Neurotrophin-3, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ntf3P20181 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ntf3P20181 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ntf3P20181 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ntf3P20181 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ntf3P20181 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ntf3P20181 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ntf3P20181 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ntf3P20181 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ntf3P20181 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ntf3P20181 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ntf3P20181 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ntf3P20181 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ntf3P20181 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ntf3P20181 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ntf3P20181 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ntf3P20181 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ntf3P20181 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ntf3P20181 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ntf3P20181 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ntf3P20181 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ntf3P20181 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ntf3P20181 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ntf3P20181 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ntf3P20181 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ntf3P20181 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ntf3P20181 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ntf3P20181 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ntf3P20181 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ntf3P20181 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ntf3P20181 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ntf3P20181 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ntf3P20181 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ntf3P20181 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ntf3P20181 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ntf3P20181 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ntf3P20181 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ntf3P20181 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ntf3P20181 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ntf3P20181 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ntf3P20181 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ntf3P20181 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ntf3P20181 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ntf3P20181 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ntf3P20181 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ntf3P20181 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ntf3P20181 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ntf3P20181 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ntf3P20181 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ntf3P20181 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ntf3P20181 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ntf3P20181 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ntf3P20181 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ntf3P20181 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ntf3P20181 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ntf3P20181 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ntf3P20181 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ntf3P20181 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ntf3P20181 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ntf3P20181 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ntf3P20181 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ntf3P20181 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ntf3P20181 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ntf3P20181 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ntf3P20181 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ntf3P20181 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ntf3P20181 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ntf3P20181 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ntf3P20181 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ntf3P20181 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ntf3P20181 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ntf3P20181 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ntf3P20181 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ntf3P20181 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ntf3P20181 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ntf3P20181 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ntf3P20181 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ntf3P20181 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ntf3P20181 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ntf3P20181 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ntf3P20181 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ntf3P20181 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ntf3P20181 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ntf3P20181 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ntf3P20181 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ntf3P20181 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ntf3P20181 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ntf3P20181 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ntf3P20181 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ntf3P20181 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ntf3P20181 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ntf3P20181 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ntf3P20181 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ntf3P20181 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ntf3P20181 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ntf3P20181 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ntf3P20181 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ntf3P20181 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ntf3P20181 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ntf3P20181 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ntf3P20181 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms