Protein–RNA interactions for Protein: P18828

Sdc1, Syndecan-1, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc1P18828 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sdc1P18828 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sdc1P18828 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Sdc1P18828 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sdc1P18828 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Sdc1P18828 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sdc1P18828 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sdc1P18828 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sdc1P18828 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sdc1P18828 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sdc1P18828 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sdc1P18828 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sdc1P18828 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sdc1P18828 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sdc1P18828 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sdc1P18828 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sdc1P18828 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sdc1P18828 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sdc1P18828 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sdc1P18828 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sdc1P18828 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sdc1P18828 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sdc1P18828 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sdc1P18828 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sdc1P18828 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sdc1P18828 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sdc1P18828 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sdc1P18828 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sdc1P18828 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sdc1P18828 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sdc1P18828 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sdc1P18828 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Sdc1P18828 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sdc1P18828 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sdc1P18828 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Sdc1P18828 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sdc1P18828 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sdc1P18828 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sdc1P18828 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sdc1P18828 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sdc1P18828 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sdc1P18828 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sdc1P18828 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sdc1P18828 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sdc1P18828 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sdc1P18828 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sdc1P18828 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sdc1P18828 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sdc1P18828 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sdc1P18828 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sdc1P18828 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sdc1P18828 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sdc1P18828 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sdc1P18828 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Sdc1P18828 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Sdc1P18828 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Sdc1P18828 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sdc1P18828 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sdc1P18828 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sdc1P18828 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sdc1P18828 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sdc1P18828 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sdc1P18828 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sdc1P18828 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sdc1P18828 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sdc1P18828 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sdc1P18828 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sdc1P18828 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sdc1P18828 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sdc1P18828 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sdc1P18828 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sdc1P18828 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sdc1P18828 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sdc1P18828 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sdc1P18828 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sdc1P18828 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sdc1P18828 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sdc1P18828 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sdc1P18828 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sdc1P18828 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sdc1P18828 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sdc1P18828 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sdc1P18828 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sdc1P18828 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sdc1P18828 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sdc1P18828 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sdc1P18828 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sdc1P18828 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sdc1P18828 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sdc1P18828 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sdc1P18828 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sdc1P18828 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sdc1P18828 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sdc1P18828 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sdc1P18828 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Sdc1P18828 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sdc1P18828 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sdc1P18828 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sdc1P18828 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Sdc1P18828 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms