Protein–RNA interactions for Protein: P18654

Rps6ka3, Ribosomal protein S6 kinase alpha-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka3P18654 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rps6ka3P18654 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rps6ka3P18654 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rps6ka3P18654 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rps6ka3P18654 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rps6ka3P18654 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rps6ka3P18654 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rps6ka3P18654 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rps6ka3P18654 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rps6ka3P18654 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rps6ka3P18654 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rps6ka3P18654 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rps6ka3P18654 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rps6ka3P18654 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rps6ka3P18654 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rps6ka3P18654 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rps6ka3P18654 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rps6ka3P18654 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rps6ka3P18654 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rps6ka3P18654 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rps6ka3P18654 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rps6ka3P18654 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rps6ka3P18654 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rps6ka3P18654 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rps6ka3P18654 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rps6ka3P18654 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rps6ka3P18654 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rps6ka3P18654 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rps6ka3P18654 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rps6ka3P18654 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rps6ka3P18654 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rps6ka3P18654 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rps6ka3P18654 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rps6ka3P18654 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rps6ka3P18654 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rps6ka3P18654 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rps6ka3P18654 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rps6ka3P18654 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rps6ka3P18654 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rps6ka3P18654 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rps6ka3P18654 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rps6ka3P18654 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rps6ka3P18654 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rps6ka3P18654 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rps6ka3P18654 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rps6ka3P18654 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rps6ka3P18654 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Rps6ka3P18654 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rps6ka3P18654 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rps6ka3P18654 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rps6ka3P18654 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rps6ka3P18654 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rps6ka3P18654 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rps6ka3P18654 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rps6ka3P18654 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rps6ka3P18654 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rps6ka3P18654 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rps6ka3P18654 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rps6ka3P18654 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rps6ka3P18654 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Rps6ka3P18654 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Rps6ka3P18654 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Rps6ka3P18654 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rps6ka3P18654 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rps6ka3P18654 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rps6ka3P18654 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rps6ka3P18654 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rps6ka3P18654 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Rps6ka3P18654 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rps6ka3P18654 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Rps6ka3P18654 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Rps6ka3P18654 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Rps6ka3P18654 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Rps6ka3P18654 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rps6ka3P18654 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rps6ka3P18654 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rps6ka3P18654 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rps6ka3P18654 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rps6ka3P18654 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rps6ka3P18654 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rps6ka3P18654 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rps6ka3P18654 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rps6ka3P18654 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rps6ka3P18654 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rps6ka3P18654 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rps6ka3P18654 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rps6ka3P18654 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rps6ka3P18654 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rps6ka3P18654 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rps6ka3P18654 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rps6ka3P18654 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Rps6ka3P18654 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rps6ka3P18654 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rps6ka3P18654 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rps6ka3P18654 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rps6ka3P18654 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rps6ka3P18654 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rps6ka3P18654 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rps6ka3P18654 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rps6ka3P18654 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms