Protein–RNA interactions for Protein: P18052

Ptpra, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpraP18052 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PtpraP18052 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PtpraP18052 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PtpraP18052 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PtpraP18052 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PtpraP18052 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PtpraP18052 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PtpraP18052 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PtpraP18052 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PtpraP18052 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PtpraP18052 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PtpraP18052 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PtpraP18052 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PtpraP18052 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PtpraP18052 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PtpraP18052 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PtpraP18052 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PtpraP18052 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PtpraP18052 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PtpraP18052 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PtpraP18052 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PtpraP18052 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PtpraP18052 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PtpraP18052 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PtpraP18052 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PtpraP18052 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PtpraP18052 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PtpraP18052 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PtpraP18052 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PtpraP18052 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PtpraP18052 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PtpraP18052 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PtpraP18052 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PtpraP18052 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PtpraP18052 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PtpraP18052 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PtpraP18052 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PtpraP18052 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PtpraP18052 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PtpraP18052 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PtpraP18052 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PtpraP18052 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PtpraP18052 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PtpraP18052 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PtpraP18052 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PtpraP18052 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PtpraP18052 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PtpraP18052 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PtpraP18052 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PtpraP18052 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PtpraP18052 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PtpraP18052 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PtpraP18052 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PtpraP18052 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PtpraP18052 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PtpraP18052 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PtpraP18052 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PtpraP18052 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PtpraP18052 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PtpraP18052 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PtpraP18052 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PtpraP18052 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PtpraP18052 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PtpraP18052 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PtpraP18052 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PtpraP18052 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PtpraP18052 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PtpraP18052 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PtpraP18052 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PtpraP18052 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PtpraP18052 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PtpraP18052 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PtpraP18052 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PtpraP18052 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PtpraP18052 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PtpraP18052 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PtpraP18052 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PtpraP18052 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PtpraP18052 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PtpraP18052 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PtpraP18052 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PtpraP18052 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
PtpraP18052 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PtpraP18052 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
PtpraP18052 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PtpraP18052 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
PtpraP18052 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PtpraP18052 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
PtpraP18052 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PtpraP18052 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
PtpraP18052 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PtpraP18052 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PtpraP18052 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PtpraP18052 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PtpraP18052 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PtpraP18052 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PtpraP18052 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
PtpraP18052 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PtpraP18052 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PtpraP18052 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms