Protein–RNA interactions for Protein: P17918

Pcna, Proliferating cell nuclear antigen, mousemouse

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcnaP17918 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PcnaP17918 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PcnaP17918 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PcnaP17918 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PcnaP17918 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PcnaP17918 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PcnaP17918 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PcnaP17918 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PcnaP17918 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PcnaP17918 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PcnaP17918 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PcnaP17918 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PcnaP17918 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PcnaP17918 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PcnaP17918 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PcnaP17918 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
PcnaP17918 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PcnaP17918 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PcnaP17918 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
PcnaP17918 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PcnaP17918 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PcnaP17918 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PcnaP17918 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PcnaP17918 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PcnaP17918 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PcnaP17918 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PcnaP17918 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
PcnaP17918 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PcnaP17918 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PcnaP17918 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PcnaP17918 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PcnaP17918 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PcnaP17918 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PcnaP17918 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PcnaP17918 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PcnaP17918 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PcnaP17918 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PcnaP17918 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PcnaP17918 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PcnaP17918 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PcnaP17918 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PcnaP17918 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PcnaP17918 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PcnaP17918 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PcnaP17918 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PcnaP17918 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PcnaP17918 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PcnaP17918 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PcnaP17918 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PcnaP17918 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PcnaP17918 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PcnaP17918 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PcnaP17918 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PcnaP17918 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PcnaP17918 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PcnaP17918 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PcnaP17918 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PcnaP17918 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PcnaP17918 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PcnaP17918 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PcnaP17918 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PcnaP17918 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PcnaP17918 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PcnaP17918 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PcnaP17918 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PcnaP17918 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PcnaP17918 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PcnaP17918 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PcnaP17918 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PcnaP17918 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PcnaP17918 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PcnaP17918 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PcnaP17918 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PcnaP17918 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PcnaP17918 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PcnaP17918 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PcnaP17918 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PcnaP17918 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PcnaP17918 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PcnaP17918 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PcnaP17918 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PcnaP17918 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PcnaP17918 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PcnaP17918 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PcnaP17918 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PcnaP17918 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PcnaP17918 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PcnaP17918 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PcnaP17918 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PcnaP17918 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PcnaP17918 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PcnaP17918 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PcnaP17918 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PcnaP17918 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PcnaP17918 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PcnaP17918 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PcnaP17918 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PcnaP17918 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PcnaP17918 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PcnaP17918 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
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