Protein–RNA interactions for Protein: P17533

Defa-rs1, Alpha-defensin-related sequence 1, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa-rs1P17533 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Defa-rs1P17533 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Defa-rs1P17533 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Defa-rs1P17533 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Defa-rs1P17533 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Defa-rs1P17533 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Defa-rs1P17533 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Defa-rs1P17533 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Defa-rs1P17533 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Defa-rs1P17533 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Defa-rs1P17533 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Defa-rs1P17533 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Defa-rs1P17533 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Defa-rs1P17533 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Defa-rs1P17533 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Defa-rs1P17533 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Defa-rs1P17533 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Defa-rs1P17533 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Defa-rs1P17533 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Defa-rs1P17533 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Defa-rs1P17533 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Defa-rs1P17533 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Defa-rs1P17533 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Defa-rs1P17533 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Defa-rs1P17533 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Defa-rs1P17533 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Defa-rs1P17533 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Defa-rs1P17533 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Defa-rs1P17533 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Defa-rs1P17533 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Defa-rs1P17533 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Defa-rs1P17533 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Defa-rs1P17533 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Defa-rs1P17533 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Defa-rs1P17533 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Defa-rs1P17533 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Defa-rs1P17533 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Defa-rs1P17533 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Defa-rs1P17533 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Defa-rs1P17533 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.64■□□□□ 0.26
Defa-rs1P17533 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Defa-rs1P17533 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Defa-rs1P17533 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Defa-rs1P17533 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Defa-rs1P17533 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Defa-rs1P17533 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Defa-rs1P17533 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Defa-rs1P17533 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Defa-rs1P17533 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Defa-rs1P17533 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Defa-rs1P17533 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Defa-rs1P17533 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Defa-rs1P17533 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Defa-rs1P17533 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Defa-rs1P17533 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Defa-rs1P17533 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Defa-rs1P17533 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Defa-rs1P17533 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Defa-rs1P17533 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Defa-rs1P17533 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Defa-rs1P17533 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Defa-rs1P17533 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Defa-rs1P17533 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Defa-rs1P17533 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Defa-rs1P17533 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Defa-rs1P17533 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Defa-rs1P17533 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Defa-rs1P17533 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Defa-rs1P17533 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Defa-rs1P17533 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Defa-rs1P17533 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Defa-rs1P17533 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Defa-rs1P17533 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Defa-rs1P17533 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Defa-rs1P17533 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Defa-rs1P17533 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Defa-rs1P17533 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Defa-rs1P17533 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Defa-rs1P17533 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Defa-rs1P17533 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Defa-rs1P17533 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Defa-rs1P17533 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Defa-rs1P17533 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Defa-rs1P17533 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Defa-rs1P17533 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Defa-rs1P17533 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Defa-rs1P17533 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Defa-rs1P17533 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Defa-rs1P17533 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Defa-rs1P17533 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Defa-rs1P17533 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Defa-rs1P17533 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Defa-rs1P17533 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Defa-rs1P17533 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Defa-rs1P17533 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Defa-rs1P17533 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Defa-rs1P17533 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Defa-rs1P17533 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Defa-rs1P17533 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Defa-rs1P17533 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms