Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sptan1P16546 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Sptan1P16546 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sptan1P16546 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Sptan1P16546 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sptan1P16546 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sptan1P16546 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sptan1P16546 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sptan1P16546 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sptan1P16546 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sptan1P16546 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sptan1P16546 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sptan1P16546 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sptan1P16546 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sptan1P16546 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sptan1P16546 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Sptan1P16546 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sptan1P16546 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sptan1P16546 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Sptan1P16546 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sptan1P16546 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sptan1P16546 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sptan1P16546 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sptan1P16546 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sptan1P16546 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sptan1P16546 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sptan1P16546 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sptan1P16546 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sptan1P16546 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sptan1P16546 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sptan1P16546 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sptan1P16546 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sptan1P16546 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sptan1P16546 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sptan1P16546 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sptan1P16546 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sptan1P16546 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sptan1P16546 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sptan1P16546 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sptan1P16546 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sptan1P16546 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sptan1P16546 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sptan1P16546 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sptan1P16546 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sptan1P16546 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sptan1P16546 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sptan1P16546 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sptan1P16546 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sptan1P16546 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sptan1P16546 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sptan1P16546 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sptan1P16546 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sptan1P16546 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sptan1P16546 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sptan1P16546 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Sptan1P16546 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sptan1P16546 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sptan1P16546 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sptan1P16546 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sptan1P16546 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sptan1P16546 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sptan1P16546 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sptan1P16546 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sptan1P16546 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sptan1P16546 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sptan1P16546 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sptan1P16546 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sptan1P16546 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sptan1P16546 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sptan1P16546 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sptan1P16546 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sptan1P16546 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sptan1P16546 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sptan1P16546 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sptan1P16546 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Sptan1P16546 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sptan1P16546 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sptan1P16546 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sptan1P16546 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sptan1P16546 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sptan1P16546 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sptan1P16546 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sptan1P16546 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sptan1P16546 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sptan1P16546 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sptan1P16546 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sptan1P16546 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sptan1P16546 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sptan1P16546 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sptan1P16546 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sptan1P16546 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sptan1P16546 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sptan1P16546 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sptan1P16546 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sptan1P16546 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sptan1P16546 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sptan1P16546 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sptan1P16546 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sptan1P16546 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sptan1P16546 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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