Protein–RNA interactions for Protein: P16390

Kcna3, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 3, mousemouse

Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcna3P16390 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Kcna3P16390 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Kcna3P16390 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Kcna3P16390 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Kcna3P16390 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kcna3P16390 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kcna3P16390 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kcna3P16390 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kcna3P16390 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kcna3P16390 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Kcna3P16390 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kcna3P16390 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Kcna3P16390 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kcna3P16390 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kcna3P16390 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kcna3P16390 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kcna3P16390 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Kcna3P16390 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Kcna3P16390 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Kcna3P16390 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Kcna3P16390 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Kcna3P16390 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Kcna3P16390 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Kcna3P16390 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Kcna3P16390 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Kcna3P16390 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Kcna3P16390 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Kcna3P16390 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Kcna3P16390 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Kcna3P16390 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Kcna3P16390 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Kcna3P16390 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Kcna3P16390 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kcna3P16390 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kcna3P16390 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kcna3P16390 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kcna3P16390 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kcna3P16390 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kcna3P16390 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kcna3P16390 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kcna3P16390 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kcna3P16390 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kcna3P16390 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Kcna3P16390 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kcna3P16390 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Kcna3P16390 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kcna3P16390 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kcna3P16390 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kcna3P16390 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kcna3P16390 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kcna3P16390 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kcna3P16390 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kcna3P16390 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kcna3P16390 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kcna3P16390 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kcna3P16390 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kcna3P16390 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Kcna3P16390 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Kcna3P16390 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kcna3P16390 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kcna3P16390 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kcna3P16390 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kcna3P16390 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kcna3P16390 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kcna3P16390 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kcna3P16390 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kcna3P16390 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kcna3P16390 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kcna3P16390 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kcna3P16390 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kcna3P16390 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kcna3P16390 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kcna3P16390 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kcna3P16390 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kcna3P16390 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kcna3P16390 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kcna3P16390 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kcna3P16390 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kcna3P16390 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Kcna3P16390 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kcna3P16390 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kcna3P16390 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kcna3P16390 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kcna3P16390 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Kcna3P16390 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Kcna3P16390 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Kcna3P16390 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kcna3P16390 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kcna3P16390 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kcna3P16390 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kcna3P16390 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kcna3P16390 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Kcna3P16390 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Kcna3P16390 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Kcna3P16390 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Kcna3P16390 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Kcna3P16390 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Kcna3P16390 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Kcna3P16390 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Kcna3P16390 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms