Protein–RNA interactions for Protein: P16054

Prkce, Protein kinase C epsilon type, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkceP16054 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PrkceP16054 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PrkceP16054 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PrkceP16054 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PrkceP16054 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PrkceP16054 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PrkceP16054 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PrkceP16054 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PrkceP16054 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PrkceP16054 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PrkceP16054 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PrkceP16054 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PrkceP16054 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PrkceP16054 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PrkceP16054 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PrkceP16054 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PrkceP16054 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PrkceP16054 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PrkceP16054 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PrkceP16054 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PrkceP16054 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PrkceP16054 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PrkceP16054 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PrkceP16054 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PrkceP16054 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PrkceP16054 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PrkceP16054 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PrkceP16054 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PrkceP16054 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PrkceP16054 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PrkceP16054 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PrkceP16054 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PrkceP16054 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PrkceP16054 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PrkceP16054 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PrkceP16054 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PrkceP16054 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PrkceP16054 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PrkceP16054 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PrkceP16054 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
PrkceP16054 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PrkceP16054 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PrkceP16054 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PrkceP16054 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PrkceP16054 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PrkceP16054 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PrkceP16054 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PrkceP16054 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PrkceP16054 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PrkceP16054 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PrkceP16054 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PrkceP16054 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PrkceP16054 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PrkceP16054 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PrkceP16054 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PrkceP16054 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PrkceP16054 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PrkceP16054 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PrkceP16054 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PrkceP16054 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PrkceP16054 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PrkceP16054 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PrkceP16054 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PrkceP16054 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PrkceP16054 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PrkceP16054 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PrkceP16054 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PrkceP16054 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PrkceP16054 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PrkceP16054 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PrkceP16054 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PrkceP16054 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PrkceP16054 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PrkceP16054 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PrkceP16054 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PrkceP16054 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PrkceP16054 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PrkceP16054 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PrkceP16054 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PrkceP16054 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PrkceP16054 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PrkceP16054 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PrkceP16054 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PrkceP16054 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PrkceP16054 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PrkceP16054 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PrkceP16054 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PrkceP16054 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PrkceP16054 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PrkceP16054 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PrkceP16054 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PrkceP16054 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PrkceP16054 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PrkceP16054 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PrkceP16054 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PrkceP16054 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PrkceP16054 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PrkceP16054 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PrkceP16054 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PrkceP16054 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms