Protein–RNA interactions for Protein: P15975

Usp53, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 53, mousemouse

Predictions only

Length 1,069 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp53P15975 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp53P15975 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp53P15975 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp53P15975 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp53P15975 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp53P15975 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp53P15975 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp53P15975 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp53P15975 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp53P15975 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp53P15975 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp53P15975 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp53P15975 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp53P15975 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp53P15975 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp53P15975 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp53P15975 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp53P15975 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp53P15975 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp53P15975 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp53P15975 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp53P15975 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp53P15975 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp53P15975 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp53P15975 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp53P15975 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp53P15975 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp53P15975 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp53P15975 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp53P15975 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp53P15975 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp53P15975 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp53P15975 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp53P15975 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp53P15975 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp53P15975 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp53P15975 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp53P15975 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp53P15975 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp53P15975 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp53P15975 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp53P15975 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp53P15975 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp53P15975 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp53P15975 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp53P15975 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp53P15975 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp53P15975 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp53P15975 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp53P15975 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp53P15975 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp53P15975 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp53P15975 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp53P15975 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp53P15975 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp53P15975 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp53P15975 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp53P15975 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp53P15975 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp53P15975 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp53P15975 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp53P15975 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp53P15975 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Usp53P15975 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp53P15975 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp53P15975 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp53P15975 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp53P15975 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp53P15975 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp53P15975 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp53P15975 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp53P15975 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp53P15975 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp53P15975 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp53P15975 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp53P15975 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp53P15975 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp53P15975 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp53P15975 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp53P15975 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp53P15975 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp53P15975 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp53P15975 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp53P15975 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp53P15975 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp53P15975 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp53P15975 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp53P15975 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp53P15975 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp53P15975 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp53P15975 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp53P15975 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp53P15975 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp53P15975 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp53P15975 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp53P15975 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp53P15975 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp53P15975 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp53P15975 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp53P15975 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms