Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Vpreb2P13373 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Vpreb2P13373 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Vpreb2P13373 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Vpreb2P13373 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Vpreb2P13373 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Vpreb2P13373 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Vpreb2P13373 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Vpreb2P13373 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Vpreb2P13373 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Vpreb2P13373 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Vpreb2P13373 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Vpreb2P13373 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Vpreb2P13373 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Vpreb2P13373 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Vpreb2P13373 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Vpreb2P13373 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Vpreb2P13373 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Vpreb2P13373 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Vpreb2P13373 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Vpreb2P13373 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Vpreb2P13373 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Vpreb2P13373 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Vpreb2P13373 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Vpreb2P13373 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Vpreb2P13373 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Vpreb2P13373 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Vpreb2P13373 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Vpreb2P13373 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Vpreb2P13373 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Vpreb2P13373 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Vpreb2P13373 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Vpreb2P13373 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Vpreb2P13373 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Vpreb2P13373 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Vpreb2P13373 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Vpreb2P13373 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Vpreb2P13373 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Vpreb2P13373 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Vpreb2P13373 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Vpreb2P13373 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Vpreb2P13373 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Vpreb2P13373 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Vpreb2P13373 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Vpreb2P13373 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Vpreb2P13373 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Vpreb2P13373 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Vpreb2P13373 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Vpreb2P13373 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Vpreb2P13373 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Vpreb2P13373 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Vpreb2P13373 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Vpreb2P13373 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Vpreb2P13373 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Vpreb2P13373 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Vpreb2P13373 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Vpreb2P13373 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Vpreb2P13373 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Vpreb2P13373 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Vpreb2P13373 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Vpreb2P13373 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Vpreb2P13373 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Vpreb2P13373 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Vpreb2P13373 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Vpreb2P13373 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Vpreb2P13373 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Vpreb2P13373 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Vpreb2P13373 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Vpreb2P13373 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Vpreb2P13373 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Vpreb2P13373 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Vpreb2P13373 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Vpreb2P13373 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Vpreb2P13373 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Vpreb2P13373 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Vpreb2P13373 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Vpreb2P13373 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Vpreb2P13373 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Vpreb2P13373 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Vpreb2P13373 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Vpreb2P13373 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Vpreb2P13373 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Vpreb2P13373 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Vpreb2P13373 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Vpreb2P13373 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Vpreb2P13373 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Vpreb2P13373 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Vpreb2P13373 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Vpreb2P13373 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Vpreb2P13373 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Vpreb2P13373 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Vpreb2P13373 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Vpreb2P13373 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Vpreb2P13373 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Vpreb2P13373 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Vpreb2P13373 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Vpreb2P13373 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Vpreb2P13373 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Vpreb2P13373 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Vpreb2P13373 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms