Protein–RNA interactions for Protein: P12658

Calb1, Calbindin, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb1P12658 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Calb1P12658 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Calb1P12658 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Calb1P12658 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Calb1P12658 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Calb1P12658 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Calb1P12658 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Calb1P12658 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Calb1P12658 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Calb1P12658 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Calb1P12658 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Calb1P12658 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Calb1P12658 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Calb1P12658 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Calb1P12658 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Calb1P12658 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Calb1P12658 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Calb1P12658 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Calb1P12658 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Calb1P12658 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Calb1P12658 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Calb1P12658 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Calb1P12658 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Calb1P12658 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Calb1P12658 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Calb1P12658 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Calb1P12658 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Calb1P12658 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Calb1P12658 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Calb1P12658 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Calb1P12658 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Calb1P12658 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Calb1P12658 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Calb1P12658 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Calb1P12658 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Calb1P12658 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Calb1P12658 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Calb1P12658 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Calb1P12658 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Calb1P12658 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Calb1P12658 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Calb1P12658 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Calb1P12658 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Calb1P12658 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Calb1P12658 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Calb1P12658 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Calb1P12658 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Calb1P12658 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Calb1P12658 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Calb1P12658 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Calb1P12658 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Calb1P12658 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Calb1P12658 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Calb1P12658 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Calb1P12658 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Calb1P12658 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Calb1P12658 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Calb1P12658 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Calb1P12658 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Calb1P12658 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Calb1P12658 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Calb1P12658 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Calb1P12658 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Calb1P12658 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Calb1P12658 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Calb1P12658 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Calb1P12658 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Calb1P12658 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Calb1P12658 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Calb1P12658 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Calb1P12658 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Calb1P12658 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Calb1P12658 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Calb1P12658 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Calb1P12658 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Calb1P12658 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Calb1P12658 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Calb1P12658 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Calb1P12658 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Calb1P12658 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Calb1P12658 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Calb1P12658 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Calb1P12658 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Calb1P12658 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Calb1P12658 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Calb1P12658 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Calb1P12658 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Calb1P12658 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Calb1P12658 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Calb1P12658 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Calb1P12658 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Calb1P12658 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Calb1P12658 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Calb1P12658 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Calb1P12658 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Calb1P12658 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Calb1P12658 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Calb1P12658 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Calb1P12658 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Calb1P12658 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms