Protein–RNA interactions for Protein: P11725

Otc, Ornithine carbamoyltransferase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtcP11725 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
OtcP11725 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
OtcP11725 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
OtcP11725 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
OtcP11725 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
OtcP11725 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
OtcP11725 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
OtcP11725 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
OtcP11725 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
OtcP11725 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
OtcP11725 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
OtcP11725 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
OtcP11725 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
OtcP11725 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
OtcP11725 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
OtcP11725 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
OtcP11725 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
OtcP11725 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
OtcP11725 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
OtcP11725 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
OtcP11725 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
OtcP11725 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
OtcP11725 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
OtcP11725 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
OtcP11725 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
OtcP11725 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
OtcP11725 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
OtcP11725 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
OtcP11725 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
OtcP11725 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
OtcP11725 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
OtcP11725 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
OtcP11725 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
OtcP11725 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
OtcP11725 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
OtcP11725 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
OtcP11725 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
OtcP11725 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
OtcP11725 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
OtcP11725 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
OtcP11725 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
OtcP11725 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
OtcP11725 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
OtcP11725 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
OtcP11725 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
OtcP11725 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
OtcP11725 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
OtcP11725 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
OtcP11725 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
OtcP11725 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
OtcP11725 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
OtcP11725 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
OtcP11725 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
OtcP11725 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
OtcP11725 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
OtcP11725 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
OtcP11725 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
OtcP11725 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
OtcP11725 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
OtcP11725 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
OtcP11725 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
OtcP11725 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
OtcP11725 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
OtcP11725 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
OtcP11725 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
OtcP11725 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
OtcP11725 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
OtcP11725 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
OtcP11725 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
OtcP11725 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
OtcP11725 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
OtcP11725 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
OtcP11725 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
OtcP11725 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
OtcP11725 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
OtcP11725 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
OtcP11725 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
OtcP11725 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
OtcP11725 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
OtcP11725 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
OtcP11725 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
OtcP11725 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
OtcP11725 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
OtcP11725 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
OtcP11725 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
OtcP11725 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
OtcP11725 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
OtcP11725 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
OtcP11725 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
OtcP11725 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
OtcP11725 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
OtcP11725 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
OtcP11725 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
OtcP11725 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
OtcP11725 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
OtcP11725 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
OtcP11725 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
OtcP11725 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
OtcP11725 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
OtcP11725 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms