Protein–RNA interactions for Protein: P11531

Dmd, Dystrophin, mousemouse

Predictions only

Length 3,678 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DmdP11531 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DmdP11531 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DmdP11531 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DmdP11531 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DmdP11531 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DmdP11531 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DmdP11531 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DmdP11531 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DmdP11531 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DmdP11531 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DmdP11531 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DmdP11531 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DmdP11531 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DmdP11531 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DmdP11531 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DmdP11531 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DmdP11531 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DmdP11531 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DmdP11531 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DmdP11531 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DmdP11531 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DmdP11531 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DmdP11531 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DmdP11531 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DmdP11531 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DmdP11531 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DmdP11531 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DmdP11531 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DmdP11531 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DmdP11531 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DmdP11531 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DmdP11531 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DmdP11531 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DmdP11531 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DmdP11531 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DmdP11531 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DmdP11531 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
DmdP11531 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DmdP11531 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DmdP11531 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DmdP11531 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DmdP11531 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DmdP11531 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DmdP11531 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
DmdP11531 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DmdP11531 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DmdP11531 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DmdP11531 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DmdP11531 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DmdP11531 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DmdP11531 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DmdP11531 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DmdP11531 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DmdP11531 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DmdP11531 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DmdP11531 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DmdP11531 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DmdP11531 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DmdP11531 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DmdP11531 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DmdP11531 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
DmdP11531 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
DmdP11531 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DmdP11531 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
DmdP11531 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
DmdP11531 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
DmdP11531 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DmdP11531 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DmdP11531 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DmdP11531 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DmdP11531 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DmdP11531 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DmdP11531 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DmdP11531 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DmdP11531 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DmdP11531 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DmdP11531 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DmdP11531 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DmdP11531 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DmdP11531 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DmdP11531 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DmdP11531 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DmdP11531 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DmdP11531 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DmdP11531 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DmdP11531 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DmdP11531 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DmdP11531 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
DmdP11531 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DmdP11531 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DmdP11531 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DmdP11531 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DmdP11531 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DmdP11531 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DmdP11531 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DmdP11531 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DmdP11531 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DmdP11531 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DmdP11531 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DmdP11531 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms