Protein–RNA interactions for Protein: P10493

Nid1, Nidogen-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nid1P10493 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nid1P10493 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nid1P10493 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nid1P10493 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nid1P10493 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nid1P10493 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nid1P10493 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nid1P10493 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nid1P10493 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nid1P10493 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nid1P10493 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nid1P10493 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nid1P10493 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nid1P10493 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nid1P10493 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nid1P10493 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nid1P10493 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nid1P10493 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nid1P10493 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nid1P10493 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nid1P10493 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nid1P10493 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nid1P10493 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nid1P10493 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nid1P10493 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nid1P10493 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nid1P10493 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nid1P10493 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nid1P10493 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nid1P10493 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nid1P10493 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Nid1P10493 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nid1P10493 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nid1P10493 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nid1P10493 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nid1P10493 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nid1P10493 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Nid1P10493 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nid1P10493 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nid1P10493 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nid1P10493 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nid1P10493 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nid1P10493 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nid1P10493 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Nid1P10493 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nid1P10493 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nid1P10493 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nid1P10493 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nid1P10493 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nid1P10493 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nid1P10493 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nid1P10493 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nid1P10493 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nid1P10493 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nid1P10493 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nid1P10493 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nid1P10493 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Nid1P10493 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nid1P10493 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Nid1P10493 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nid1P10493 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nid1P10493 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nid1P10493 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nid1P10493 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nid1P10493 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nid1P10493 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Nid1P10493 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nid1P10493 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nid1P10493 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nid1P10493 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nid1P10493 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nid1P10493 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nid1P10493 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nid1P10493 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nid1P10493 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nid1P10493 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nid1P10493 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nid1P10493 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nid1P10493 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nid1P10493 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nid1P10493 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nid1P10493 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nid1P10493 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nid1P10493 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nid1P10493 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nid1P10493 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nid1P10493 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nid1P10493 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nid1P10493 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nid1P10493 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nid1P10493 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nid1P10493 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nid1P10493 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nid1P10493 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nid1P10493 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nid1P10493 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nid1P10493 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nid1P10493 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nid1P10493 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Nid1P10493 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms