Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P10404 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P10404 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P10404 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P10404 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P10404 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
P10404 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
P10404 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P10404 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P10404 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P10404 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P10404 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P10404 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P10404 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
P10404 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P10404 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P10404 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P10404 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P10404 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P10404 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P10404 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P10404 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P10404 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P10404 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P10404 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
P10404 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P10404 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P10404 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P10404 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P10404 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P10404 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P10404 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P10404 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P10404 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P10404 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P10404 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P10404 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P10404 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P10404 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P10404 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P10404 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P10404 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P10404 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P10404 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P10404 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P10404 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P10404 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P10404 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P10404 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P10404 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
P10404 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P10404 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
P10404 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
P10404 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P10404 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P10404 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P10404 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P10404 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P10404 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P10404 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P10404 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P10404 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P10404 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P10404 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P10404 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P10404 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P10404 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P10404 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
P10404 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P10404 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P10404 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P10404 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P10404 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P10404 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P10404 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
P10404 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P10404 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
P10404 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P10404 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
P10404 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P10404 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P10404 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P10404 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P10404 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P10404 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P10404 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P10404 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P10404 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P10404 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P10404 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
P10404 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P10404 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P10404 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P10404 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P10404 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P10404 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P10404 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
P10404 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P10404 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
P10404 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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