Protein–RNA interactions for Protein: P10400

Pol, Retrovirus-related Pol polyprotein (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolP10400 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PolP10400 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PolP10400 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PolP10400 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PolP10400 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PolP10400 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PolP10400 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PolP10400 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PolP10400 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PolP10400 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
PolP10400 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PolP10400 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
PolP10400 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PolP10400 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PolP10400 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PolP10400 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PolP10400 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PolP10400 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PolP10400 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PolP10400 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PolP10400 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PolP10400 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PolP10400 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PolP10400 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PolP10400 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PolP10400 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PolP10400 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
PolP10400 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PolP10400 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PolP10400 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PolP10400 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PolP10400 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PolP10400 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
PolP10400 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PolP10400 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PolP10400 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PolP10400 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PolP10400 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PolP10400 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PolP10400 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PolP10400 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PolP10400 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
PolP10400 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
PolP10400 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PolP10400 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PolP10400 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PolP10400 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PolP10400 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PolP10400 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PolP10400 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PolP10400 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PolP10400 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PolP10400 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PolP10400 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PolP10400 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PolP10400 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PolP10400 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PolP10400 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PolP10400 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PolP10400 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PolP10400 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PolP10400 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PolP10400 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
PolP10400 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PolP10400 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PolP10400 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PolP10400 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
PolP10400 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
PolP10400 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
PolP10400 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PolP10400 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PolP10400 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PolP10400 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PolP10400 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PolP10400 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PolP10400 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PolP10400 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PolP10400 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PolP10400 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PolP10400 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PolP10400 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PolP10400 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PolP10400 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PolP10400 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PolP10400 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PolP10400 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
PolP10400 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PolP10400 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PolP10400 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PolP10400 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PolP10400 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PolP10400 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PolP10400 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PolP10400 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
PolP10400 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PolP10400 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
PolP10400 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PolP10400 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PolP10400 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PolP10400 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
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