Protein–RNA interactions for Protein: P10148

Ccl2, C-C motif chemokine 2, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl2P10148 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccl2P10148 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccl2P10148 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccl2P10148 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccl2P10148 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccl2P10148 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccl2P10148 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccl2P10148 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccl2P10148 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccl2P10148 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccl2P10148 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccl2P10148 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccl2P10148 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccl2P10148 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccl2P10148 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccl2P10148 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccl2P10148 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccl2P10148 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccl2P10148 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccl2P10148 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccl2P10148 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccl2P10148 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccl2P10148 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccl2P10148 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccl2P10148 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccl2P10148 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccl2P10148 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccl2P10148 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccl2P10148 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccl2P10148 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccl2P10148 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccl2P10148 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccl2P10148 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccl2P10148 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccl2P10148 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccl2P10148 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccl2P10148 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccl2P10148 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccl2P10148 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccl2P10148 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccl2P10148 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccl2P10148 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccl2P10148 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccl2P10148 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccl2P10148 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccl2P10148 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccl2P10148 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccl2P10148 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccl2P10148 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccl2P10148 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccl2P10148 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccl2P10148 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccl2P10148 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccl2P10148 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccl2P10148 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccl2P10148 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccl2P10148 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccl2P10148 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccl2P10148 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccl2P10148 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccl2P10148 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccl2P10148 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccl2P10148 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccl2P10148 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccl2P10148 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccl2P10148 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccl2P10148 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccl2P10148 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccl2P10148 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccl2P10148 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccl2P10148 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccl2P10148 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccl2P10148 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccl2P10148 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccl2P10148 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl2P10148 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl2P10148 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl2P10148 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl2P10148 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl2P10148 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl2P10148 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl2P10148 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl2P10148 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl2P10148 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl2P10148 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl2P10148 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl2P10148 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl2P10148 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl2P10148 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl2P10148 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl2P10148 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl2P10148 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl2P10148 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl2P10148 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl2P10148 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl2P10148 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccl2P10148 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccl2P10148 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccl2P10148 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccl2P10148 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms