Protein–RNA interactions for Protein: P0CW02

Ly6c1, Lymphocyte antigen 6C1, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly6c1P0CW02 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ly6c1P0CW02 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ly6c1P0CW02 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ly6c1P0CW02 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ly6c1P0CW02 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ly6c1P0CW02 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ly6c1P0CW02 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ly6c1P0CW02 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ly6c1P0CW02 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ly6c1P0CW02 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ly6c1P0CW02 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ly6c1P0CW02 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ly6c1P0CW02 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ly6c1P0CW02 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ly6c1P0CW02 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ly6c1P0CW02 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ly6c1P0CW02 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ly6c1P0CW02 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ly6c1P0CW02 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ly6c1P0CW02 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ly6c1P0CW02 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ly6c1P0CW02 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ly6c1P0CW02 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ly6c1P0CW02 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ly6c1P0CW02 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ly6c1P0CW02 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ly6c1P0CW02 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ly6c1P0CW02 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ly6c1P0CW02 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ly6c1P0CW02 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ly6c1P0CW02 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ly6c1P0CW02 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ly6c1P0CW02 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ly6c1P0CW02 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ly6c1P0CW02 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ly6c1P0CW02 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ly6c1P0CW02 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ly6c1P0CW02 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ly6c1P0CW02 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ly6c1P0CW02 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ly6c1P0CW02 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ly6c1P0CW02 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ly6c1P0CW02 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ly6c1P0CW02 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ly6c1P0CW02 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ly6c1P0CW02 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ly6c1P0CW02 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ly6c1P0CW02 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ly6c1P0CW02 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ly6c1P0CW02 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ly6c1P0CW02 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ly6c1P0CW02 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ly6c1P0CW02 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ly6c1P0CW02 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Ly6c1P0CW02 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ly6c1P0CW02 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ly6c1P0CW02 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ly6c1P0CW02 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ly6c1P0CW02 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ly6c1P0CW02 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ly6c1P0CW02 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ly6c1P0CW02 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ly6c1P0CW02 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ly6c1P0CW02 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ly6c1P0CW02 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ly6c1P0CW02 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ly6c1P0CW02 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ly6c1P0CW02 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ly6c1P0CW02 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ly6c1P0CW02 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ly6c1P0CW02 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ly6c1P0CW02 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ly6c1P0CW02 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ly6c1P0CW02 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ly6c1P0CW02 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ly6c1P0CW02 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ly6c1P0CW02 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ly6c1P0CW02 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ly6c1P0CW02 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ly6c1P0CW02 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ly6c1P0CW02 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ly6c1P0CW02 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ly6c1P0CW02 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ly6c1P0CW02 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ly6c1P0CW02 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ly6c1P0CW02 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ly6c1P0CW02 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ly6c1P0CW02 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ly6c1P0CW02 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ly6c1P0CW02 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ly6c1P0CW02 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ly6c1P0CW02 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ly6c1P0CW02 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ly6c1P0CW02 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ly6c1P0CW02 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ly6c1P0CW02 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ly6c1P0CW02 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ly6c1P0CW02 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ly6c1P0CW02 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ly6c1P0CW02 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms