Protein–RNA interactions for Protein: P0C6B7

Igsf6, Immunoglobulin superfamily member 6, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igsf6P0C6B7 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Igsf6P0C6B7 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Igsf6P0C6B7 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Igsf6P0C6B7 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Igsf6P0C6B7 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Igsf6P0C6B7 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Igsf6P0C6B7 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Igsf6P0C6B7 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Igsf6P0C6B7 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Igsf6P0C6B7 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Igsf6P0C6B7 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Igsf6P0C6B7 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Igsf6P0C6B7 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Igsf6P0C6B7 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Igsf6P0C6B7 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Igsf6P0C6B7 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Igsf6P0C6B7 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Igsf6P0C6B7 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Igsf6P0C6B7 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Igsf6P0C6B7 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Igsf6P0C6B7 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Igsf6P0C6B7 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Igsf6P0C6B7 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Igsf6P0C6B7 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Igsf6P0C6B7 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Igsf6P0C6B7 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Igsf6P0C6B7 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Igsf6P0C6B7 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Igsf6P0C6B7 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Igsf6P0C6B7 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Igsf6P0C6B7 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Igsf6P0C6B7 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Igsf6P0C6B7 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Igsf6P0C6B7 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Igsf6P0C6B7 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Igsf6P0C6B7 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Igsf6P0C6B7 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Igsf6P0C6B7 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Igsf6P0C6B7 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Igsf6P0C6B7 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Igsf6P0C6B7 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Igsf6P0C6B7 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Igsf6P0C6B7 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Igsf6P0C6B7 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Igsf6P0C6B7 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Igsf6P0C6B7 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Igsf6P0C6B7 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Igsf6P0C6B7 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Igsf6P0C6B7 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Igsf6P0C6B7 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Igsf6P0C6B7 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Igsf6P0C6B7 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Igsf6P0C6B7 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Igsf6P0C6B7 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Igsf6P0C6B7 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Igsf6P0C6B7 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Igsf6P0C6B7 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Igsf6P0C6B7 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Igsf6P0C6B7 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Igsf6P0C6B7 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Igsf6P0C6B7 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Igsf6P0C6B7 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Igsf6P0C6B7 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Igsf6P0C6B7 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Igsf6P0C6B7 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Igsf6P0C6B7 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Igsf6P0C6B7 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Igsf6P0C6B7 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Igsf6P0C6B7 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Igsf6P0C6B7 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Igsf6P0C6B7 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Igsf6P0C6B7 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Igsf6P0C6B7 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Igsf6P0C6B7 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Igsf6P0C6B7 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Igsf6P0C6B7 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Igsf6P0C6B7 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Igsf6P0C6B7 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Igsf6P0C6B7 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Igsf6P0C6B7 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Igsf6P0C6B7 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Igsf6P0C6B7 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Igsf6P0C6B7 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Igsf6P0C6B7 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Igsf6P0C6B7 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Igsf6P0C6B7 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Igsf6P0C6B7 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Igsf6P0C6B7 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Igsf6P0C6B7 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Igsf6P0C6B7 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Igsf6P0C6B7 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Igsf6P0C6B7 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Igsf6P0C6B7 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Igsf6P0C6B7 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Igsf6P0C6B7 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Igsf6P0C6B7 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Igsf6P0C6B7 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Igsf6P0C6B7 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Igsf6P0C6B7 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Igsf6P0C6B7 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms