Protein–RNA interactions for Protein: P0C1T1

Hoxb2, Homeobox protein Hox-B2, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb2P0C1T1 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxb2P0C1T1 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxb2P0C1T1 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxb2P0C1T1 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxb2P0C1T1 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxb2P0C1T1 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxb2P0C1T1 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxb2P0C1T1 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxb2P0C1T1 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxb2P0C1T1 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxb2P0C1T1 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxb2P0C1T1 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxb2P0C1T1 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxb2P0C1T1 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxb2P0C1T1 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxb2P0C1T1 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxb2P0C1T1 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxb2P0C1T1 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxb2P0C1T1 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxb2P0C1T1 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxb2P0C1T1 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxb2P0C1T1 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxb2P0C1T1 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxb2P0C1T1 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxb2P0C1T1 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxb2P0C1T1 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxb2P0C1T1 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxb2P0C1T1 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxb2P0C1T1 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxb2P0C1T1 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxb2P0C1T1 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxb2P0C1T1 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxb2P0C1T1 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxb2P0C1T1 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxb2P0C1T1 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxb2P0C1T1 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxb2P0C1T1 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxb2P0C1T1 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxb2P0C1T1 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxb2P0C1T1 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxb2P0C1T1 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxb2P0C1T1 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxb2P0C1T1 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxb2P0C1T1 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxb2P0C1T1 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxb2P0C1T1 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxb2P0C1T1 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxb2P0C1T1 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxb2P0C1T1 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxb2P0C1T1 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxb2P0C1T1 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxb2P0C1T1 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxb2P0C1T1 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxb2P0C1T1 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxb2P0C1T1 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxb2P0C1T1 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxb2P0C1T1 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxb2P0C1T1 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxb2P0C1T1 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxb2P0C1T1 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxb2P0C1T1 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxb2P0C1T1 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxb2P0C1T1 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxb2P0C1T1 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxb2P0C1T1 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxb2P0C1T1 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxb2P0C1T1 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxb2P0C1T1 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxb2P0C1T1 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxb2P0C1T1 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxb2P0C1T1 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxb2P0C1T1 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxb2P0C1T1 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxb2P0C1T1 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxb2P0C1T1 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxb2P0C1T1 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hoxb2P0C1T1 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hoxb2P0C1T1 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hoxb2P0C1T1 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxb2P0C1T1 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxb2P0C1T1 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxb2P0C1T1 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxb2P0C1T1 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxb2P0C1T1 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxb2P0C1T1 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxb2P0C1T1 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxb2P0C1T1 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxb2P0C1T1 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxb2P0C1T1 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxb2P0C1T1 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxb2P0C1T1 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxb2P0C1T1 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxb2P0C1T1 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxb2P0C1T1 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxb2P0C1T1 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxb2P0C1T1 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxb2P0C1T1 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxb2P0C1T1 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxb2P0C1T1 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxb2P0C1T1 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms