Protein–RNA interactions for Protein: P09631

Hoxa9, Homeobox protein Hox-A9, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa9P09631 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxa9P09631 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxa9P09631 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxa9P09631 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxa9P09631 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxa9P09631 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxa9P09631 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxa9P09631 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxa9P09631 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxa9P09631 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxa9P09631 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxa9P09631 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxa9P09631 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxa9P09631 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxa9P09631 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxa9P09631 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxa9P09631 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxa9P09631 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxa9P09631 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxa9P09631 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxa9P09631 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxa9P09631 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxa9P09631 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxa9P09631 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxa9P09631 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxa9P09631 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxa9P09631 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxa9P09631 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxa9P09631 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxa9P09631 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxa9P09631 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxa9P09631 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxa9P09631 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxa9P09631 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxa9P09631 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxa9P09631 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxa9P09631 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxa9P09631 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxa9P09631 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxa9P09631 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxa9P09631 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxa9P09631 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxa9P09631 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxa9P09631 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxa9P09631 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxa9P09631 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxa9P09631 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxa9P09631 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxa9P09631 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxa9P09631 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxa9P09631 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxa9P09631 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxa9P09631 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxa9P09631 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxa9P09631 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxa9P09631 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxa9P09631 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxa9P09631 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxa9P09631 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxa9P09631 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxa9P09631 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxa9P09631 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxa9P09631 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxa9P09631 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxa9P09631 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxa9P09631 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxa9P09631 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxa9P09631 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxa9P09631 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxa9P09631 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxa9P09631 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxa9P09631 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxa9P09631 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxa9P09631 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxa9P09631 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxa9P09631 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxa9P09631 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxa9P09631 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxa9P09631 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Hoxa9P09631 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Hoxa9P09631 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hoxa9P09631 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hoxa9P09631 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hoxa9P09631 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hoxa9P09631 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hoxa9P09631 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hoxa9P09631 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hoxa9P09631 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hoxa9P09631 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hoxa9P09631 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hoxa9P09631 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hoxa9P09631 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxa9P09631 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxa9P09631 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxa9P09631 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxa9P09631 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxa9P09631 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxa9P09631 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxa9P09631 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxa9P09631 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms