Protein–RNA interactions for Protein: P08032

Spta1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spta1P08032 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Spta1P08032 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Spta1P08032 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Spta1P08032 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Spta1P08032 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Spta1P08032 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Spta1P08032 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Spta1P08032 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Spta1P08032 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Spta1P08032 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Spta1P08032 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Spta1P08032 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Spta1P08032 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Spta1P08032 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Spta1P08032 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Spta1P08032 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Spta1P08032 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Spta1P08032 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Spta1P08032 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Spta1P08032 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Spta1P08032 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Spta1P08032 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Spta1P08032 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Spta1P08032 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Spta1P08032 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Spta1P08032 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Spta1P08032 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Spta1P08032 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Spta1P08032 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Spta1P08032 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Spta1P08032 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Spta1P08032 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Spta1P08032 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Spta1P08032 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Spta1P08032 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Spta1P08032 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Spta1P08032 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Spta1P08032 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Spta1P08032 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Spta1P08032 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Spta1P08032 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Spta1P08032 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Spta1P08032 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Spta1P08032 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Spta1P08032 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Spta1P08032 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Spta1P08032 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Spta1P08032 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Spta1P08032 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Spta1P08032 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Spta1P08032 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Spta1P08032 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Spta1P08032 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Spta1P08032 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Spta1P08032 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Spta1P08032 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Spta1P08032 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Spta1P08032 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Spta1P08032 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Spta1P08032 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Spta1P08032 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Spta1P08032 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Spta1P08032 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Spta1P08032 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Spta1P08032 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Spta1P08032 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Spta1P08032 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Spta1P08032 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Spta1P08032 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Spta1P08032 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Spta1P08032 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Spta1P08032 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Spta1P08032 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Spta1P08032 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Spta1P08032 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Spta1P08032 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Spta1P08032 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Spta1P08032 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Spta1P08032 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Spta1P08032 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Spta1P08032 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Spta1P08032 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Spta1P08032 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Spta1P08032 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Spta1P08032 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Spta1P08032 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Spta1P08032 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Spta1P08032 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Spta1P08032 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Spta1P08032 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Spta1P08032 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Spta1P08032 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Spta1P08032 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Spta1P08032 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Spta1P08032 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Spta1P08032 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Spta1P08032 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Spta1P08032 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Spta1P08032 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Spta1P08032 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms