Protein–RNA interactions for Protein: P06728

Apoa4, Apolipoprotein A-IV, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa4P06728 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Apoa4P06728 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Apoa4P06728 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Apoa4P06728 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Apoa4P06728 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Apoa4P06728 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Apoa4P06728 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Apoa4P06728 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Apoa4P06728 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Apoa4P06728 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Apoa4P06728 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Apoa4P06728 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Apoa4P06728 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Apoa4P06728 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Apoa4P06728 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Apoa4P06728 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Apoa4P06728 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Apoa4P06728 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Apoa4P06728 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Apoa4P06728 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Apoa4P06728 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Apoa4P06728 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Apoa4P06728 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Apoa4P06728 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Apoa4P06728 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Apoa4P06728 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Apoa4P06728 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Apoa4P06728 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Apoa4P06728 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Apoa4P06728 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Apoa4P06728 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Apoa4P06728 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Apoa4P06728 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Apoa4P06728 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Apoa4P06728 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Apoa4P06728 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Apoa4P06728 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Apoa4P06728 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Apoa4P06728 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Apoa4P06728 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Apoa4P06728 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Apoa4P06728 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Apoa4P06728 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Apoa4P06728 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Apoa4P06728 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Apoa4P06728 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Apoa4P06728 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Apoa4P06728 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Apoa4P06728 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Apoa4P06728 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Apoa4P06728 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Apoa4P06728 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Apoa4P06728 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Apoa4P06728 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Apoa4P06728 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Apoa4P06728 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Apoa4P06728 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Apoa4P06728 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Apoa4P06728 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Apoa4P06728 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Apoa4P06728 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Apoa4P06728 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Apoa4P06728 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Apoa4P06728 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Apoa4P06728 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Apoa4P06728 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Apoa4P06728 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Apoa4P06728 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Apoa4P06728 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Apoa4P06728 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Apoa4P06728 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Apoa4P06728 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Apoa4P06728 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Apoa4P06728 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Apoa4P06728 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Apoa4P06728 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Apoa4P06728 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Apoa4P06728 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Apoa4P06728 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Apoa4P06728 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Apoa4P06728 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Apoa4P06728 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Apoa4P06728 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Apoa4P06728 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Apoa4P06728 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Apoa4P06728 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Apoa4P06728 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Apoa4P06728 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Apoa4P06728 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Apoa4P06728 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Apoa4P06728 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Apoa4P06728 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Apoa4P06728 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Apoa4P06728 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Apoa4P06728 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Apoa4P06728 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Apoa4P06728 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Apoa4P06728 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Apoa4P06728 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Apoa4P06728 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms