Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
H2-Eb1P04230 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
H2-Eb1P04230 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
H2-Eb1P04230 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
H2-Eb1P04230 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
H2-Eb1P04230 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
H2-Eb1P04230 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
H2-Eb1P04230 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
H2-Eb1P04230 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
H2-Eb1P04230 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
H2-Eb1P04230 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
H2-Eb1P04230 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
H2-Eb1P04230 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
H2-Eb1P04230 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
H2-Eb1P04230 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
H2-Eb1P04230 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
H2-Eb1P04230 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
H2-Eb1P04230 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
H2-Eb1P04230 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
H2-Eb1P04230 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
H2-Eb1P04230 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
H2-Eb1P04230 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
H2-Eb1P04230 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
H2-Eb1P04230 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
H2-Eb1P04230 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
H2-Eb1P04230 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
H2-Eb1P04230 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
H2-Eb1P04230 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
H2-Eb1P04230 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
H2-Eb1P04230 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
H2-Eb1P04230 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
H2-Eb1P04230 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
H2-Eb1P04230 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
H2-Eb1P04230 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
H2-Eb1P04230 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
H2-Eb1P04230 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
H2-Eb1P04230 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
H2-Eb1P04230 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
H2-Eb1P04230 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
H2-Eb1P04230 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
H2-Eb1P04230 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
H2-Eb1P04230 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
H2-Eb1P04230 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
H2-Eb1P04230 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
H2-Eb1P04230 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
H2-Eb1P04230 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
H2-Eb1P04230 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
H2-Eb1P04230 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
H2-Eb1P04230 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
H2-Eb1P04230 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
H2-Eb1P04230 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
H2-Eb1P04230 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
H2-Eb1P04230 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
H2-Eb1P04230 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
H2-Eb1P04230 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
H2-Eb1P04230 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
H2-Eb1P04230 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
H2-Eb1P04230 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
H2-Eb1P04230 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
H2-Eb1P04230 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
H2-Eb1P04230 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
H2-Eb1P04230 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
H2-Eb1P04230 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
H2-Eb1P04230 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
H2-Eb1P04230 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
H2-Eb1P04230 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
H2-Eb1P04230 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
H2-Eb1P04230 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
H2-Eb1P04230 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
H2-Eb1P04230 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
H2-Eb1P04230 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
H2-Eb1P04230 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
H2-Eb1P04230 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
H2-Eb1P04230 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
H2-Eb1P04230 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
H2-Eb1P04230 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
H2-Eb1P04230 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
H2-Eb1P04230 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
H2-Eb1P04230 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
H2-Eb1P04230 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
H2-Eb1P04230 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
H2-Eb1P04230 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
H2-Eb1P04230 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
H2-Eb1P04230 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
H2-Eb1P04230 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
H2-Eb1P04230 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
H2-Eb1P04230 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
H2-Eb1P04230 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
H2-Eb1P04230 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
H2-Eb1P04230 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
H2-Eb1P04230 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
H2-Eb1P04230 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
H2-Eb1P04230 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
H2-Eb1P04230 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
H2-Eb1P04230 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
H2-Eb1P04230 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
H2-Eb1P04230 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
H2-Eb1P04230 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
H2-Eb1P04230 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
H2-Eb1P04230 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms