Protein–RNA interactions for Protein: P03953

Cfd, Complement factor D, mousemouse

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CfdP03953 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CfdP03953 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CfdP03953 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CfdP03953 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CfdP03953 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CfdP03953 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CfdP03953 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CfdP03953 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CfdP03953 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CfdP03953 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CfdP03953 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CfdP03953 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CfdP03953 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CfdP03953 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CfdP03953 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CfdP03953 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CfdP03953 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CfdP03953 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CfdP03953 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CfdP03953 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CfdP03953 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CfdP03953 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CfdP03953 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CfdP03953 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CfdP03953 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CfdP03953 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CfdP03953 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CfdP03953 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CfdP03953 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CfdP03953 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CfdP03953 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
CfdP03953 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CfdP03953 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CfdP03953 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CfdP03953 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CfdP03953 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CfdP03953 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CfdP03953 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CfdP03953 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CfdP03953 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CfdP03953 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CfdP03953 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CfdP03953 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CfdP03953 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CfdP03953 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CfdP03953 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CfdP03953 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CfdP03953 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CfdP03953 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CfdP03953 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CfdP03953 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CfdP03953 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CfdP03953 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CfdP03953 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CfdP03953 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CfdP03953 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CfdP03953 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CfdP03953 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CfdP03953 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CfdP03953 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CfdP03953 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CfdP03953 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CfdP03953 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CfdP03953 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CfdP03953 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CfdP03953 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CfdP03953 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CfdP03953 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CfdP03953 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CfdP03953 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CfdP03953 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CfdP03953 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CfdP03953 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CfdP03953 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CfdP03953 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CfdP03953 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CfdP03953 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CfdP03953 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CfdP03953 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CfdP03953 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CfdP03953 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CfdP03953 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CfdP03953 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CfdP03953 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CfdP03953 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CfdP03953 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CfdP03953 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CfdP03953 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CfdP03953 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CfdP03953 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CfdP03953 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CfdP03953 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CfdP03953 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CfdP03953 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CfdP03953 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CfdP03953 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CfdP03953 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CfdP03953 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CfdP03953 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CfdP03953 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms