Protein–RNA interactions for Protein: P01921

H2-Ab1, H-2 class II histocompatibility antigen, A-D beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Ab1P01921 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-Ab1P01921 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-Ab1P01921 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-Ab1P01921 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-Ab1P01921 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-Ab1P01921 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-Ab1P01921 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-Ab1P01921 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-Ab1P01921 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-Ab1P01921 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-Ab1P01921 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-Ab1P01921 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-Ab1P01921 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-Ab1P01921 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-Ab1P01921 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-Ab1P01921 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-Ab1P01921 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-Ab1P01921 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2-Ab1P01921 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2-Ab1P01921 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2-Ab1P01921 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2-Ab1P01921 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2-Ab1P01921 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2-Ab1P01921 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2-Ab1P01921 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2-Ab1P01921 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2-Ab1P01921 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2-Ab1P01921 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2-Ab1P01921 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-Ab1P01921 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-Ab1P01921 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-Ab1P01921 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-Ab1P01921 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-Ab1P01921 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-Ab1P01921 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-Ab1P01921 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-Ab1P01921 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-Ab1P01921 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-Ab1P01921 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-Ab1P01921 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-Ab1P01921 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-Ab1P01921 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-Ab1P01921 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-Ab1P01921 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-Ab1P01921 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-Ab1P01921 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-Ab1P01921 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-Ab1P01921 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-Ab1P01921 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-Ab1P01921 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-Ab1P01921 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-Ab1P01921 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-Ab1P01921 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-Ab1P01921 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-Ab1P01921 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-Ab1P01921 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-Ab1P01921 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-Ab1P01921 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-Ab1P01921 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-Ab1P01921 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-Ab1P01921 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-Ab1P01921 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-Ab1P01921 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-Ab1P01921 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-Ab1P01921 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-Ab1P01921 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-Ab1P01921 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-Ab1P01921 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-Ab1P01921 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-Ab1P01921 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-Ab1P01921 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-Ab1P01921 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-Ab1P01921 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-Ab1P01921 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-Ab1P01921 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-Ab1P01921 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-Ab1P01921 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-Ab1P01921 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-Ab1P01921 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-Ab1P01921 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-Ab1P01921 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-Ab1P01921 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-Ab1P01921 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-Ab1P01921 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-Ab1P01921 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-Ab1P01921 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-Ab1P01921 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-Ab1P01921 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-Ab1P01921 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-Ab1P01921 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-Ab1P01921 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-Ab1P01921 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-Ab1P01921 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-Ab1P01921 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-Ab1P01921 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-Ab1P01921 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-Ab1P01921 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-Ab1P01921 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-Ab1P01921 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-Ab1P01921 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms