Protein–RNA interactions for Protein: P01822

Ig heavy chain V region MOPC 315, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01822 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
P01822 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01822 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01822 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01822 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01822 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01822 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01822 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01822 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
P01822 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01822 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01822 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01822 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01822 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01822 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01822 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01822 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01822 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01822 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01822 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01822 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01822 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01822 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01822 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
P01822 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
P01822 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
P01822 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01822 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01822 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01822 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01822 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01822 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01822 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01822 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01822 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01822 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01822 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01822 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
P01822 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01822 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01822 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01822 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01822 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01822 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01822 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01822 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01822 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01822 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01822 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01822 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01822 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
P01822 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01822 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01822 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01822 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01822 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01822 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01822 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01822 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01822 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
P01822 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01822 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01822 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01822 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01822 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01822 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01822 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01822 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01822 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01822 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01822 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01822 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01822 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01822 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01822 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01822 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01822 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01822 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01822 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01822 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01822 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01822 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01822 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
P01822 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01822 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01822 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01822 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01822 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01822 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01822 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01822 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
P01822 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01822 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01822 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
P01822 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01822 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01822 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01822 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01822 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01822 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms