Protein–RNA interactions for Protein: P01803

Ig heavy chain V region AMPC1, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01803 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01803 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01803 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01803 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01803 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01803 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01803 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
P01803 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01803 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01803 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01803 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01803 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
P01803 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01803 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01803 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01803 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01803 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01803 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01803 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01803 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01803 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
P01803 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01803 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01803 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01803 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
P01803 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01803 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01803 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01803 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01803 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01803 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01803 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01803 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P01803 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P01803 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P01803 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
P01803 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
P01803 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
P01803 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01803 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01803 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01803 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01803 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01803 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
P01803 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01803 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01803 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01803 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01803 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01803 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01803 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01803 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01803 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01803 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01803 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01803 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01803 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01803 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01803 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01803 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01803 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01803 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01803 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01803 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01803 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
P01803 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
P01803 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01803 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01803 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
P01803 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01803 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01803 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01803 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01803 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01803 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01803 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01803 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01803 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01803 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01803 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01803 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01803 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01803 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01803 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01803 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01803 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01803 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01803 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01803 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01803 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01803 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01803 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01803 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01803 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01803 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01803 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01803 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01803 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01803 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01803 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms