Protein–RNA interactions for Protein: P01800

Ig heavy chain V-III region T957, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01800 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
P01800 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01800 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01800 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
P01800 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01800 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01800 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01800 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01800 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01800 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01800 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
P01800 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01800 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01800 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
P01800 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01800 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01800 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01800 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
P01800 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01800 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01800 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01800 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01800 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
P01800 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01800 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01800 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01800 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01800 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01800 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01800 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01800 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01800 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01800 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01800 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
P01800 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01800 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01800 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01800 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01800 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01800 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01800 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01800 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01800 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01800 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01800 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01800 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01800 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01800 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01800 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01800 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01800 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01800 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01800 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01800 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
P01800 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01800 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01800 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01800 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01800 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01800 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01800 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01800 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01800 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01800 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01800 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01800 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01800 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01800 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01800 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01800 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01800 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01800 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01800 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01800 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01800 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01800 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01800 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01800 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01800 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01800 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
P01800 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01800 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01800 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01800 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01800 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01800 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01800 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01800 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
P01800 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01800 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01800 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
P01800 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01800 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01800 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01800 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01800 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01800 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01800 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01800 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01800 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms