Protein–RNA interactions for Protein: P01641

Ig kappa chain V-V region MOPC 173B, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01641 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
P01641 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
P01641 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
P01641 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
P01641 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
P01641 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
P01641 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
P01641 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
P01641 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
P01641 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
P01641 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
P01641 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
P01641 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
P01641 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
P01641 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
P01641 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
P01641 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
P01641 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
P01641 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
P01641 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
P01641 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
P01641 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
P01641 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
P01641 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
P01641 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
P01641 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
P01641 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
P01641 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
P01641 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
P01641 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
P01641 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
P01641 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
P01641 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
P01641 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
P01641 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
P01641 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
P01641 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
P01641 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
P01641 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
P01641 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
P01641 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
P01641 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
P01641 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
P01641 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
P01641 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
P01641 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
P01641 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
P01641 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
P01641 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
P01641 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
P01641 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
P01641 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
P01641 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
P01641 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
P01641 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
P01641 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
P01641 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
P01641 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
P01641 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
P01641 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
P01641 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
P01641 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
P01641 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
P01641 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
P01641 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
P01641 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
P01641 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
P01641 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
P01641 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
P01641 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
P01641 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
P01641 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
P01641 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
P01641 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
P01641 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
P01641 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
P01641 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
P01641 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
P01641 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
P01641 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
P01641 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
P01641 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
P01641 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
P01641 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
P01641 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
P01641 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
P01641 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
P01641 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
P01641 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
P01641 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
P01641 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
P01641 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
P01641 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
P01641 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
P01641 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
P01641 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P01641 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P01641 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P01641 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P01641 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms